关于生物学理论研究知识内容.pptVIP

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北京大学理论生物学中心 及分子设计课题组介绍;; 目前中心校内成员12人,国内兼职教授30人,国外特聘教授8人。其中有北京大学物理学院、化学与分子工程学院、数学学院、力学与工程科学系、生命科学学院的老师进行研究生和博士后的指导工作。 中心现有博士后4人,跨学科研究生30余人。每年招生10名左右的跨学科研究生。;Activities;Research;Research;;; 生物信息学 蛋白质晶体学;我们所关注的问题;发展了进行蛋白质表面环区构象模拟的计算方法,Proteins 2002, JMM2001。 蛋白质侧链安装算法,Proteins 2003. 蛋白质-蛋白质相互作用的平均势计算方法,JBC, Proteins 2002.;Correlation between the calculated logP values and the experimental values of 1831 organic compounds;Abbott Laboratories, D-47E, AP10, 100 Abbott Park Rd., Abbott Park, IL 60064-3500 Comparison of programs clogp, alogp, klogp, mlogp, qlogp, xlogp, ACD kowin. Daylight Chemical Information Systems, Inc. 表现最好的几个logp计算程序: ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????;Perdomo-Lopez I, Rodriguez-Perez AI, Yzquierdo-Peiro JM, et al. Effect of cyclodextrins on the solubility and antimycotic activity of sertaconazole: Experimental and computational studies J PHARM SCI 91 (11): 2408-2415 NOV 2002 ;SCORE: 计算蛋白质与配体结合自由能的方法 RX. Wang, LH Lai,et.al.,,J. Mol. Mod. 1998, 4: 379-394,在国内外拥有192家用户 ;基于晶体复合物重构的打分函数评价(刚性对接);SCORE应用举例I Novartis 药物公司筛选出高活性的CK2抑制剂 (Vangrevelinghe, E; J. Med. Chem.; 2003; 46(13); 2656-2662) ;?SCORE应用举例II University of Alabama at Birmingham搜索喋啶还原酶抑制剂 (Schormann N, J MOL STRUC-THEOCHEM 635: 37-44);LigBuilder: A software package for de novo ligand building-up;POCKET: Deriving the pharmacophore;;2003年12月31日以前注册的用户; ;PSI-DOCK: A Highly Efficient Approach to Flexible Ligand Docking Jianfeng Pei, Qi Wang, Qingliang Li, Zhenming Liu, Kun Yang and Luhua Lai, submitted to JMC;致 谢

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