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- 2019-04-05 发布于上海
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魏妮娜遵
魏妮娜
遵义医学院硕士学位论文
万方数据
万方数据
贵州苗药艾纳香 DNA 条形码的鉴定研究
中文摘要
目的:应用 DNA 条形码对贵州苗药艾纳香及其混伪品进行鉴定,以确定 DNA 条形 码技术在中药鉴定中的有效性。
方法:分别提取艾纳香及其混伪品的 DNA,对其 DNA 中 ITS、psbA-trnH、matK、 rbcL 序列进行 PCR 扩增和测序,应用 CodonCode Aligner V3.0 对测序峰图进行校对 拼接,去除低质量序列及引物区,获得靶序列。应用 MEGA5.0 软件计算物种种内种 间 Kimura2-parameter (K2P)遗传距离;采用相似性搜索法、最近距离法、构建 NJ 系 统发育树等方法对候选序列进行鉴定分析。
结果:获得苗药艾纳香的ITS、psbA-trnH完整序列及rbcL、matK部分序列;苗药艾 纳香ITS、ITS2、psbA-trnH三个序列的种间最小K2P遗传距离远大于种内最大K2P遗传
距离;基于三个序列构建的NJ系统发育树中可看出,艾纳香与其近缘种单独聚为一枝,
表现出单系性,能明显与伪品大叶紫珠分开。
结论:相对于rbcL、matK、psbA-trnH序列,ITS2序列最适合用于鉴别艾纳香及其近
缘种和伪品,为有效鉴定艾纳香提供了科学依据。
关键词:艾纳香;ITS 序列;ITS2 序列;rbcL 序列;matK 序
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