白芨内生细菌组成及多样性分析.pdfVIP

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2019-04-04 发布于浙江
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白芨内生细菌组成及多样性分析.pdf

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of 南方农业学报JournalSouthern Agriculture lSSN NNXAAB 2095—1191；CODEN http：Ilwws．．fnyxb．com 191．2016．02．227 DOI：10．39690：issn．2095—1 白芨内生细菌组成及多样性分析陈泽斌1一，李冰3，王定康4，徐胜光．．，刘佳妮1，余磊·，张永福1，任稹1，靳松1 (1昆明学院农学院，昆明650214；2云南省都市特色农业工程技术研究中心，昆明650214；3中国科学院昆明动物研究所，昆明650223；4昆明学院生命科学与技术系．昆明650214) 摘要：【目的】调查白芨内生细菌种类及多样性，为更好地保护和开发利用白芨资源提供科学依据。【方法】应用 lllumina MiSeq高通量测序技术测定白芨内生细菌的16S 计样品序列数目和操作分类单元(oTus)数量，分析物种丰度及分布的差异。【结果】获得用于分析的有效序列和OTU 数为49550／48；稀释曲线表明测序深度充分，OTU的数量接近于饱和。白芨内生细菌主要分布于鞘脂单胞菌属种群。lllumina MiSeq高通量测序技术能准确反映植物内生微生物的种类组成和真实比例，在植物内生微生物研究中具有明显的优势和可行性。关键词：高通量测序；白芨；内生细菌；多样性中图分类号：Q939．5 文献标志码：A noitairanandetcofabCDac endoDh Compositiondiversityendophytic inBJet／／／astriata CHEN Ze-binl一，LI Jia-nil，YULeil， Bin93，WANGDing—kan94，XU Sheng-guang卜，LIU 1 ZHANG Zhenl，JIN Yong-ful，RENSong ResearchCenterfor 650214，China；2Yunnan (IAgriculturalCollege，KunmingUniversity，Kunming Engineering Characteristics Institute ofSciences， Agriculture，Kunming650214，China；3KunmingofZoo