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南方农业学报JOURNALOFSOUTHERNAGRICULTURE2012,43(6):733—737
ISSN2095—1 NNXAAB
191;CODEN http://www.nfnyxb.corn
DOI:10.3969/j:issn.2095-1191.2012.06.733
干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及
EST序列分析
罗海斌1,曹辉庆1,魏源文p,邓智年1,潘有强1,郭元元1,何海波1,李杨瑞1’2+
(1广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室;2农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室,南宁530007)
摘要:【目的】构建甘蔗根系全长cDNA文库,并进行测序,为分离克隆甘蔗抗旱候选基因奠定基础。【方法】在干旱
胁迫条件下,以新台糖22号甘蔗根系为材料,采用SMART技术构建cDNA文库,并进行EST序列分析。【结果】文库构建
质量鉴定结果显示,文库库容量为1.Oxl06PFU/mL,重组率约95%,文库插入片段长度在500~2000bp,平均长度约
1102.1
bp。挑选526个阳性克隆进行单向测序后,共获得523个ESTs序列,去除载体、接头序列以及长度低于100bp的
439个,分别占总数的6.5%和93.5%。通
序列后,进行聚类分析并组装,共得至11468个Uni—ESTs,其中congtig29个,singlets
过与NCBHE冗余蛋白库进行BLASTX
获得一批新的未知蛋白功能基因。
关键词:cDNA文库;甘蔗;根系;表达序列标签;测序
中图分类号:$566.1 文献标志码:A 文章编号:2095—1191(2012)06—0733—05
Constructionof eDNA anditsEST
full-lengthlibrary sequence
in rootat under stress
analysissugarcaneseedlingstage drought
LUO
Hai—binl,CAP1,WEIYuan—wen”,DENGZhi-nianl,PAN1,
Hui—qing You—qiang
GUO Hai-b01,LI 1,2+
Yuan-yuanl,HEYang-rui
Genetic and andGenetic
(1GuangxiCrop ImprovementBiotechnologyLab;2KeyLaboratoryofSugarcaneBitechnotogy
530007,China)
Improvement(Guangxi),MinistryofAgricuhrue,Nanning
wasconductedtoconstructcDNA of root and
Abstract:【Objective】Thepresentexperiment librarysugarcanelength
isolation
to referreneeon andcloneof
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