干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及EST序列分析.pdfVIP

干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及EST序列分析.pdf

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南方农业学报JOURNALOFSOUTHERNAGRICULTURE2012,43(6):733—737 ISSN2095—1 NNXAAB 191;CODEN http://www.nfnyxb.corn DOI:10.3969/j:issn.2095-1191.2012.06.733 干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及 EST序列分析 罗海斌1,曹辉庆1,魏源文p,邓智年1,潘有强1,郭元元1,何海波1,李杨瑞1’2+ (1广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室;2农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室,南宁530007) 摘要:【目的】构建甘蔗根系全长cDNA文库,并进行测序,为分离克隆甘蔗抗旱候选基因奠定基础。【方法】在干旱 胁迫条件下,以新台糖22号甘蔗根系为材料,采用SMART技术构建cDNA文库,并进行EST序列分析。【结果】文库构建 质量鉴定结果显示,文库库容量为1.Oxl06PFU/mL,重组率约95%,文库插入片段长度在500~2000bp,平均长度约 1102.1 bp。挑选526个阳性克隆进行单向测序后,共获得523个ESTs序列,去除载体、接头序列以及长度低于100bp的 439个,分别占总数的6.5%和93.5%。通 序列后,进行聚类分析并组装,共得至11468个Uni—ESTs,其中congtig29个,singlets 过与NCBHE冗余蛋白库进行BLASTX 获得一批新的未知蛋白功能基因。 关键词:cDNA文库;甘蔗;根系;表达序列标签;测序 中图分类号:$566.1 文献标志码:A 文章编号:2095—1191(2012)06—0733—05 Constructionof eDNA anditsEST full-lengthlibrary sequence in rootat under stress analysissugarcaneseedlingstage drought LUO Hai—binl,CAP1,WEIYuan—wen”,DENGZhi-nianl,PAN1, Hui—qing You—qiang GUO Hai-b01,LI 1,2+ Yuan-yuanl,HEYang-rui Genetic and andGenetic (1GuangxiCrop ImprovementBiotechnologyLab;2KeyLaboratoryofSugarcaneBitechnotogy 530007,China) Improvement(Guangxi),MinistryofAgricuhrue,Nanning wasconductedtoconstructcDNA of root and Abstract:【Objective】Thepresentexperiment librarysugarcanelength isolation to referreneeon andcloneof

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