哺乳动物Gpx基因家族进化选择和功能分歧研究-重庆师范大学学报.PDF

! #$ 年% 月 重庆师范大学学报（自然科学版） ’() #$ 第* 卷 第 期 +,-(.’/ ,0 12,.345.3 6,(7’/ 8.59:(;5=（6’-(’/ ?5:.?: ） @,/) * 6,) 动物科学 ABC ：16DC ：E#F$$GEH 6) #$#%$I ) $*J ) ##G 哺乳动物 !# 基因家族进化选择和功能分歧研究! $， $ 杨红文 ，金! 丹 （$) 华中农业大学 生命科学与技术学院，武汉I%##J# ； ) 福建漳州师范学院生物系，福建 漳州%G%### ） 摘要：研究哺乳动物谷胱甘肽过氧化物酶基因家族（!# ）的亲缘关系和进化选择压力性质。从61KC 等网站获取哺 乳动物!# 基因编码区核酸序列和LMN 蛋白氨基酸序列，并用OLP 、1/-;’/ 构建亲缘关系树，用53.’/M 和Q’(3:M 分析信号肽和亚细胞定位信息；用D :;57’,( 和MPR 分析其!# 基因家族进化先后顺序和选择压力；用A59:(3: 分 析LMN 蛋白家族功能分歧。结果表明，LMN 蛋白家族进化中形成两个亚类，其一包括 LMN$ 和 LMN ，其二包括 LMN% 、LMNE 和LMNG ；各LMN 蛋白成员均有高度保守的LMN 蛋白家族基序和高度保守的硒代半胱氨酸或半胱氨酸 残基，氨基端信号肽分析显示， LMN$ 蛋白为胞浆线粒体型，其余家族成员均为胞外分泌型；哺乳动物!# $ 基因进化 上受到严格的负选择作用，!# 基因家族成员保守区也受到负选择作用，但用枝位点模型却检出了正选择作用，LMN 蛋白家族内存在轻微的功能分歧。哺乳动物LMN 蛋白家族的进化上的负选择作用表明其在哺乳动物清除自由基抗 氧化方面的关键作用。 关键词： !# 基因；哺乳动物；结构域；进化分析；功能分歧 S*E$T % 文献标志码：P! ! ! 文章编号：$GJF GG*%（#$ ）#F ##%#F #G 中图分类号： ! ! 动物细胞在氧化磷酸化产能代谢中产生了大量 在植物的胁迫反应和动物的清除自由基抗氧化方面 高反应活性的超氧自由基和过氧化物，如不及时清 发挥关键作用，随着大量生物!# 基因序列的破译， 除会攻击细胞中膜结构、酶和 A6P ，加重动脉粥样 对其生物信息学的分析成为可能，寄生性吸虫和拟 南芥中 ［%FI ］ 硬化及诱发恶性肿瘤。机体清除自由基和过氧化物 !# 基因生物信息学已陆续开展 ，哺乳动 的系统包括维生素O 、维生素1 、谷胱甘肽LU 等非 物的相关研究则还未见报道。本文尝试对常见哺乳 酶还原性成分及超氧化物歧化酶（BA ）、过氧化氢 动物!# 基因家族的结构域、进化先后顺序、进化选 酶（1PQ ）、谷胱甘肽过氧化物酶（LMN ）等酶防御系 择压力和蛋白质功能分歧加以分析，以期对哺乳动 统，其中因部分家族成员含稀有的硒代半胱氨酸 物LMN 蛋白家族的深入研究有所裨益。 （:? ）而著称的LMN 蛋白家族在清除细胞内生物膜 $ 材料和方法 中的磷脂氢过氧化物和过氧化氢方面起主要作 用［$］。从人和小鼠体内分别鉴定出V 个LMN 蛋白 $T $ 基因序列获取 家族成员，其它哺乳动物中也陆续发现LMN 蛋白成 在61KC 网站通过关键词“LWX ”搜索各数据库 员的存在。依效应部位及氨基酸序列不同， 中人（ LMN 蛋 $%% ’( )*+’ ）、小鼠（,-’ -’.-/-’ ）等哺乳动 白家族大