牛SOCS5基因5 调控区多态性研究.pdfVIP

OFSOUTHERNAGRICULTURE 南方农业学报JOURNAL 2013，44(8)：1362—1366 ISSN 2095-l191；CODENNNXAAB http：／／www．nfnyxb．ca DOI：10．39690：issn．2095一1191．2013．8．1362 牛SO嗍因5’调控区多态性研究 杨永强1，谢海强1，刘 彬1，孙岩岩1，赵顺林1，肖希希1，龚俞2， 焦仁刚2，张依裕1，刘若余” (1贵州大学动物科学学蒯高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室／贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室，贵阳550025 2贵州省畜牧技术推广站，贵阳550001) 摘要：【目的】筛选SOCs5基因启动子区多态位点(SNP)，并研究其对启动子功能元件的影响。【方法】选择贵州 地方优良品种务川黑牛和中国荷斯坦奶牛两种生长性能差异明显的品种构建DNA池，直接测序后用DNASTAR软 件进行序列拼接和校正，BLAST分析SOa强基因多态性，然后用生物信息学软件预测序列核心启动子区和CpG岛， 分析SNP位点对转录因子结合位点影响。【结果】牛soc鼬基因5’调控区和第1外显子区存在3个SNP位点，分别为： C．577T、T．43C和C+61T，其中C+61T与SNP数据库中的rsl 物信息学软件预测得到s0Cs瑾因核心启动子区和CpG岛，SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点 产生；SNP位点对转录因子结合位点有显著影响，但对核心启动子范围和起始位点无明显影响，不在甲基化水平上 影响SOCS5基因表达水平。【结论】牛socs5基因5’调控区存在3个对启动子功能元件有较大影响的SNP位点。 关键词：SOCS5基因；SNP位点；启动子；CpG岛；贵州务川黑牛；中国荷斯坦奶牛 中图分类号：$823 文献标志码：A of ofSOCS5incattle Polymorphisms5-flankingregion gene YANG 1，XIE 1，LIUBinl，SUN Shun-linl， Yong—qiangHai—qiang Yan—yanl，ZHAO XIAO xi—xil，GONGYu2，JIAO Ren—gan92，ZHANGYi—yul，LIURuo-yul+ ofAnimal ofAnimal and inthe (1 Sciences，GuizhouLaboratory College University／Key Genetics，BreedingReproduction PlateauMountainous ofEducation／GuizhouofAnimal and Laboratory Region，Ministry Key Genetics，BreedingReproduction， AnimalScienceand 550025，China；2Guizhou Station，Guiyang550001，China) Guiyang