广西猪瘟病毒扁桃体和流产胎儿来源株E2基因的克隆、测序及遗传学分析-预防兽医学专业论文.docxVIP

广西猪瘟病毒扁桃体和流产胎儿来源株E2基因的克隆、测序及遗传学分析-预防兽医学专业论文.docx

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广鞘大学碗士论文 广鞘大学碗士论文 广西猿瘟痛毒扁桃俸和流产胎儿塞蹲謦E2菱嬖塑塞壅!塑塑墨整焦堂熊塑 广西猪瘟病毒扁桃体和流产胎儿来源株 E2基因的克隆、测序及遗传学分毒厅 攘要 本研究采用RT-PCR技术对来自广话不同地区的120份健康猪 扁桃体和84份流产胎儿进行CSFV检测,从得到的9份阳性病料中 选取6份进行猪瘟瘸毒E2全基因的扩增、克隆、测序和遗传学分 析,得到长度为1119 bp、编码373个氨基酸残基的目的基因片 段。 应用DNAstar序列分析软件对所测定的6个广西毒株与已知序 列辩HCLV、Shimen等毒株的相应片段进行f司源性分析比较。结果 显示,HCLV与Shimen核昔酸和推定的氨基酸的同源性分别为 95,5%和94.6%,广嚣株与HCLV、Shimen拣的核苷酸阉源性分别 为92.5%~96.6%和89.8%~93.9%,推定的氨基酸同源性分别为 90.O%一98,4%和86.3%--94.1%。广匿毒株之间核苷酸和推定的氨基 酸同源性分别为93.1%~99.6%和86.3%一99.2%。说明广西毒株之闻 的同源性很高,而广西毒株与Shimen之闻同源性比较低,但与 HCLV同源性较高。6个广西毒株E2基因的所有Cys位点都没变, 可推测CSFV E2蛋是在抗原结构方面依然保持缀高的稳定性。与掭 准毒株和疫苗毒相比,广西毒株在具有中和特性的B、c区域内721 和724氯基酸位点发生了变异,这些变异可能导致E2蛋岛的抗原性 发生改变,从而使广西CSFV逃离疫苗毒的免疫保护。 广疆猪瘟癌焉扁拂俸和流产胎儿来瓣栋E2基因的竟艟、溅序及遗传学分辑 把6个广西毒株与国内外g发裘的CSFV相应序列进行比较, 并建立7遗传进化}薄。该遗传栝i主要分为两大群和一个另类,广西 株暂属予基因群i,与我国的主要参考毒株HCLV、Shlmen属干闰 一基因群,说鞲广嚣CSFV株与HCLV、Shimen娄异不大。 关键词:猪瘟病毒E2蒸溺同源性变异 广西猪瘟病毒离桃体和流产碹!!查!鐾堡墼蔓壁塑塞堕:塑塑鳖堂壁堑 CLONING AND SEQUENCING ANAI—YSIS OF 嚣2 GEN嚣oF CLASSICAL SWlNE FEVER VIRUS STRAINS IN GUANGⅪ ABSTRACT Inthis studytheE29enes of6 strainsofClassical SwineFeverVirus (CSFV)isolated from healthy pig tonsils and abortive embryos in Guangxi(GX)were amplified by n-t,snsoription polymerase chain reaction(RT-nPC鼬.These E2 gene fragments which contain 1 1 19 nucleotides in length and encoding 373 amino acid residues were cloned and sequenced。 Comparison of E2 seqences between 6 stlams and Hog Cholera Lapinised Virus(HCLV)、Shimen strains using DNAStar software WaS carried out.也e result 8howed that the homology be铆eell GX strains and HCLV were 92.5%--96.6%for nucleotide sequence and 90.0%98。4% for deduced amino acid sequence.The homology between GX strains and Shimen were 89.80/P93.9%for nucleotide sequence and 86.3%田4.1% for deduced amino acid sequence.The nucleotide homology among GX strains were 93.1~99.6%.and the deduced amino acid homology wele 86.3—99。2%。Howerer)the homology of nucleotlde and deduced amino acid sequence between HCLV and Shimen were 95.5%and 94.6%. respectively.These results demonstrated that t

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