95份南瓜种质资源亲缘关系的SSR分析.PDF

中国农学通报 2016,32(34): 135-142 Chinese Agricultural Science Bulletin 95份南瓜种质资源亲缘关系的SSR分析 1,2 1,2 1,2 1,2 王 瑞 ，吴廷全 ，钟玉娟 ，黄河勋 1 2 （广东省农业科学院蔬菜研究所，广州510640 ；广东省蔬菜新技术研究重点实验室，广州510640） 摘 要：为研究95 份南瓜资源的遗传关系，提高南瓜育种效率，应用150对简单重复序列(SSR)标记及聚 类分析方法对95 份核心资源进行遗传多样性分析。结果显示，有32 对引物能够在不同南瓜种质间扩增 出清晰而稳定的多态性标记。利用MEGA 4.0 统计软件中UPGMA 聚类分析，95 份南瓜的平均遗传距 离为0.583 ，最大为0.9412 ，最小为0 ；分支总长度SBL= 10.3384。在分支距离为0.39 时，32 对SSR 引物可 以将95 份资源可以分为3 个类群。第Ⅰ类群，主要为印度南瓜，第Ⅱ类群为中国南瓜，第Ⅲ类群71 号为 美洲南瓜。本研究为种质资源的鉴定评价，优良种质的挖掘以及品种选育提供了参考。 关键词：南瓜；SSR ；遗传多样性 中图分类号：S642.1 文献标志码：A 论文编号：cas GeneticRelationshipAnalysisof95AccessionsofSquashGermplasmsbySSRMarkers 1,2 1,2 1,2 1,2 WangRui ,WuTingquan ,ZhongYujuan ,HuangHexun 1 (VegetableResearchInstituteGuangdongAcademyofAgricultureSciences,Guangzhou510640; 2GuangdongKeyLaboratoryforNewTechnologyResearchofVegetables,Guangzhou510640) Abstract:Inordertostudytherelationshipof95accessionsofsquashgermplasmsandimprovetheefficiency ofnewvarietiesscreening, 95 squashcorecollectionsweredetectedinpolymorphismbyusing 150pairsof SSRprimers.Theresearchshowedthat 32 pairsofSSRprimerswereeffectivetoamplifyclearandstable polymorphicmarkersamongdifferentsquashcorecollections.Thesesquashcorecollectionswereclusteredby usingMegaversion 4.01.Resultsshowedthatgeneticdistanceof 95 squashgermplasms variedfrom 0 to 0.9412,theaveragegeneticdistancewas0.583,thetotallengthofthebranchSBL=10.3384.Whenthebranch lengthwas 0.39, 95 germplasmsweredividedintothreegroupsby 32 higherpolymorphi