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中山大学博士学位论文
中山大学博士学位论文 中文摘要
采集受试者的外周静脉全血,用传统的酚/氯仿法抽提基因组DNA保存各
用。
在206例样本中随机抽取16例样本,用PCR法扩增AT2基因(Angiotensin II receptor2 gene,AGTR2)全长,其中男女各8例,共24条x染色体。扩增后 的PCR产物直接测序,碱基序列通过B1ASTn软件和ClustalW软件在线分析, 得到SNPs位点。将得出的数据向美国国立生物信息技术中一tj,(National Center for Biotechnology information,NCBI)提交。
在得到的16个SNPs位点中选择位于3’非翻译区(3’untranslated region,
3UTR)的两个毗邻的位点,即G301404T和A301410G作为研究工具。
PCR法扩增一段包括两个研究位点在内的DNA片段,以标记生物素的等位 基因特异性寡核苷酸(allele specific oligonucleotide,ASO)探针为工具,用点杂 交(dotblot)的方法确定每个样本的基因型。
将所得到的基因型、单体型数据结合临床资料进行生物信息学和统计分析。
结果:
在广东人AGTR2全长中得到16个SNPs位点,此数据被NCBI收录,登陆 号AY536522。位点G301404T和A3014lOG(参照序列NT_011565.6)位于3’UTR,
分别对应NCBI dbSNP数据库中的SNP ID rs5193和rs5194。
G301404T--A301410G在男性样本中发现4种单体型:G—G,G—A,T—A, T-G;在女性样本中检出5种单体型组合:G-G/G·G,G—A/G—A,G—G/G—A,G-G/T—A 和G—G/T.G。G—G和G—A单体型在广东人群中的分布占优势,分别为51.7%和 40.4%,T-A和T-G单体型较少见,分别占4.3%和3.6%。各单体型频率在高血 压和非高血压两组人群中无差异。
Il
中山大学博士学位论文
中山大学博士学位论文 中文摘要
单体型T—A携带者(检出13例,高血压患者占61.5%)表现出较低的左室 质量和左室肥厚指数,而且T.A携带者中无冠心病患者。
结论:
通过生物信息学分析发现AGTR2是一个高突变的基因,根据这一特性
AGTR2可用于研究x染色体连锁遗传疾病,或用于法医学鉴定等方面。
本研究首次报道了G301404T和A301410G在广东人中的基因型频率和单体 型频率。这两个位点所构成的单体型与高血压病无关。而301404T--301410A单 体型表现出抑制肥厚和降低冠心病危险性的心脏保护效应。这些研究结果将为今 后进一步研究AT2基因型/表现型提供有用的分子遗传学信息。
【关键词】 血管紧张素II 2型受体基因 单核苷酸多态性 单体型
高血压病 心脏保护效应 广东人
III
中山大学博士学位论文
中山大学博士学位论文 英文摘要
SNPs and haplotypes of angiotensin II receptor 2 gene in Cantonese:a case-control association study with hypertension, and the study of haplotypes and cardioprotective roles Major:Internal Medicine
Name: Zhang Min
Supervisor:profi Ma Hong
Abstrsct
objective
The aim of the study is to explore the information of single—nucleofide
p01ymorpmsms(sNPs)of AGTR2 in Cantonese,an essential component in Chinese, and investigate the association between AT2R—genotype and hypertension· Furthermore,the association between haplotypes of AGTR2 and the cardioprotective
roles is also planed to be studied
Materials and M
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