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水通道蛋白 Aquaporin 译者：王帅 （CAAS14F2 ） 作者：David Goodsell 分子月报 日期：2014 年5 月 链接：/10.2210/rcsb_pdb/mom_2014_5 引言 细胞膜是相当防水的，形成了阻止水分子通过的屏障。然而，一些细胞需要允许更 多的水流过细胞膜。例如，肾脏中废物的浓度和眼内压都涉及到严格的的水分控制，在 这些情况下，细胞利用水通道蛋白控制水分进出细胞。 一个分子上四个通道 从细菌到人类，许多生物中都发现了水通道蛋白。它们都具有典型的结构，都由四 个相同的链组成，每条链形成的亚基中间都有一个通道。如下所述，每个通道都充满了 单向通过蛋白的水分子。四条链中间形成一个更大的由富含碳的氨基酸围成的通道，在 细胞中可能被细胞膜脂封堵。最近一个高分辨率的结构（PDB 登录号为3zoj ）显示， 水通道入口处两个带电的氨基酸是非常重要的，确定了只能是水，而不是水合氢离子或 羟基离子通过通道。 靶标水通道蛋白 因为水通道蛋白在许多细胞渗透调节方面起着至关重要的作用，所以科学家们目前 正在寻找办法阻止它的活性，从而创建治疗和水分相关的疾病的方法，例如，青光眼。 水孔蛋白最初是在观察水银阻断水分进出红血细胞时发现的，但不幸的是，水银有毒而 不能作为药物。目前，科学家正在寻找新的能阻断特定类型的水通道蛋白的抑制剂，以 期能够作为药物使用。 水-甘油跨膜蛋白通道 为了使其在不同类型细胞中发挥不同的作用，我们合成了许多不同类型的水通道蛋 白。一些对水具有高度特异性，而一些还能够允许其他分子通过。这里展示的是一种细 菌水-甘油跨膜通道蛋白，PDB 登录号为1fx8，它可以允许水和甘油通过。这里展示了 蛋白质的一个亚基，通过剪切显示通过膜的通道。值得注意的是，在通道的顶端有一个 收缩，能够控制能通过的分子类型。 结构探索 通过水通道蛋白的水通道会引起一个严重的问题：水流正常情况下能够按照 grotthuss 机制将质子从一个分子快速传递到另一个分子。这将是一个灾难，因为这将快 速地消耗为细胞膜表面许多泵提供能量的电化学梯度。水孔蛋白能够通过强迫水分子位 于特定的方向从而不能作为质子链阻止上述情况的发生。水孔蛋白中两个特定的天冬酰 胺将中央水分子（或两个水分子，PDB 登陆号为 3zoj ）固定在特定的方向。这个水分 子和通道里的氨基酸一起，与侧翼的水流相互作用，使顶端的水流朝向一个方向， 底 部的水流朝向相反的方向。点击图片查看相互作用JSmol ，该图解释了水和水通道蛋白 氨基酸的定向。这个图片在PDB 的登录号为1ymg，图片上的氢原子是手工添加的，在 晶体结构中是看不见的。 进一步研究的主题 1、PDB 中有几种不同类型的水通道蛋白的结构，你可以使用比较结构的工具研究 它们之间的相似性。 2 、许多水通道蛋白的结构是闭合的，通过氨基酸的移动封堵了水通道。科学家们 仍然在研究这是不是有活性的门控过程的一部分。 References 1、1fx8: D. Fu, A. Libson, L. J. Miercke, C. Weitzman, P. Nollert, J. Krucinski R. M. Stroud (2000) Structure of a glycerol-conducting channel and the basis for its selectivity. Science 290, 481-486. 2 、1fqy: K. Murata, K. Mitsuoka, T. Hirai, T. Walz, P. Agre, J. B. Heymann, A. Engel Y. Fujiyoshi (2000) Structural determinants of water permiation through aquaporin-1. Nature 407, 599-605. 3、1ymg: W. E. C. Harries, D. Akhavan, L. J. W. Miercke, S. Khademi R. M. Stroud (2004) The channel architecture of aquaporin O at 2.2 Angstrom resolution. Proce