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植物DNA的提取与鉴定 实验四 实验原理 真核生物DNA与蛋白质结合,以核蛋白的形式存在于细胞核内 在提取DNA时,通过研磨破坏细胞壁和细胞膜,释放出核蛋白 实验原理 ①在核蛋白溶液加入氯仿-异戊醇,振荡,使蛋白质乳化变性,再离心除去变性蛋白质。 ②用十二烷基硫酸钠(SDS)等去污剂使蛋白质变性,与核酸分离,从材料中提取出DNA。 ③用苯酚处理,然后离心分层,蛋白变性后则停留在酚层内。 ① 化学因素 核酸在pH4.0~11.0稳定, 否则就变性降解。 ② 物理因素 DNA是长链线状分子,强机械作用会使DNA分子断裂。 ③ 酶的作用 DNA酶会降解DNA分子。 紫外光吸收法鉴定DNA纯度和浓度 核酸的紫外吸收峰260nm,蛋白质280nm DNA的A260/A280约1.8,RNA的约2.0 1ug/mL的DNA溶液,吸光度A260=0.020 1ug/mL的RNA溶液,A260=0.022-0.024 1.0个A260相当于50ug/mL的DNA,40ug/mL的RNA。 实验步骤 10mL CTAB分离缓冲液加入50mL 离心管中,在65℃水浴中预热。 取剪碎的植物叶片适量,置于预冷的研钵中,倒入液氮,尽快将叶片研碎。 将约1g叶片粉末加入预热的CTAB分离缓冲液中,轻轻转动混匀,65℃保温30分钟。 加10mL氯仿-异戊醇(24:1),轻轻混匀。 室温,4000 rpm离心10分钟。 用一开口较大的滴管将上层水相吸入另一干净的50mL离心管中,加入等体积的异丙醇,轻轻混匀,使核酸沉淀下来 用玻璃棒将丝状DNA搅起,转移至10mL 70%乙醇中,浸泡洗涤10分钟 用玻璃棒取出DNA沉淀,室温下干燥 将DNA沉淀溶于0.5 mL TE缓冲液中 DNA纯度和浓度鉴定 取100uL DNA溶液(剩余的DNA溶液放在-20℃保存),用TE缓冲液稀释20,50和100倍,测定A260和A280 根据A260/A280判断DNA纯度 计算提取的DNA总量 试 剂 CTAB分离缓冲液 2% CTAB (十六烷基三甲基溴化铵) 1.4 mol/L NaCl 20 mmol/L EDTA 100 mmol/L Tris-HCL(pH8.0) 0.2% 巯基乙醇 CTAB CTAB(十六烷基三甲基溴化铵) 阳离子去污剂,它不仅能使蛋白质变性,还能与核酸形成特异的核酸-CTAB复合物。 核酸-CTAB复合物可溶于≥0.7mol/L NaCl的高盐缓冲液。 异丙醇 氯仿-异戊醇(24:1) 液氮 70%乙醇 TE 缓冲液 10mmol/L Tris-HCL (pH7.4) 1mmol/L EDTA 思考题 本实验中CTAB、EDTA、巯基乙醇的作用是什么? 吸取样品、抽提应注意什么?为什么? 提取DNA时除去蛋白质的方法有哪些? * * * * 在浓氯化钠溶液(1~2 mol/L)中,DNA核蛋白的溶解度很大,RNA核蛋白的溶解度很小。 在稀氯化钠溶液(0.14 mol/L)中,DNA核蛋白的溶解度很小,RNA核蛋白的溶解度很大。 利用不同浓度氯化钠溶液将DNA核蛋白或RNA核蛋白从样品中分别抽提出来。 去除蛋白质的方法 破坏DNA完整结构的因素 * *
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