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一、常用贮液与溶液
(一)常用缓冲液
1.磷酸缓冲液
(1)25℃下0.1mol/L磷酸钾缓冲液的配制※
pH
1mol/L K2HPO4(mL)
1mol/L KH2PO4(mL)
5.8
8.5
91.5
6.0
13.2
86.8
6.2
19.2
80.8
6.4
27.8
72.2
6.6
38.1
61.9
6.8
49.7
50.3
7.0
61.5
38.5
7.2
71.7
28.3
7.4
80.2
19.8
7.6
86.6
13.4
7.8
90.8
9.2
8.0
94.0
6.2
(2)25℃下0.1mol/L磷酸钠缓冲液的配制※
pH
1mol/L Na2HPO4(mL)
1mol/L NaH2PO4(mL)
5.8
7.9
92.1
6.0
12.0
88.0
6.2
17.8
82.2
6.4
25.5
74.5
6.6
35.2
64.8
6.8
46.3
53.7
7.0
57.7
42.3
7.2
68.4
31.6
7.4
77.4
22.6
7.6
84.5
15.5
7.8
89.6
10.4
8.0
93.2
6.8
※:用蒸馏水将混合的两种1mol/L贮存液稀释至1000mL,根据Henderson-Hasselbalch方程计算其pH值:
pH=pK’+1g([质子受体]/[质子供体])
在此,pK’=6.86(25℃)。
2.电泳缓冲液
常用的电泳缓冲液
缓冲液
使用液
浓贮存液(每升)
Tris-乙酸(TAE)
1×:0.04mol/L Tris-乙酸
50×:242g Tris碱
0.001mol/L EDTA
57.1mL冰乙酸
100mL 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
Tris-磷酸(TPE)
1×:0.09mol/L Tris-磷酸
10×:10g Tris碱
0.002mol/L EDTA
15.5mL85%磷酸(1.679g/mL)
40mL 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
Tris-硼酸(TBE)a
0.5×0.045mol/L Tris-硼酸
5×:54g Tris碱
0.001mol/L EDTA
27.5硼酸
20mL 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
碱性缓冲液b
1×:50mmol/L NaOH
1×:5mL 10mol/L NaOH
1mmol/L EDTA
2mL 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)
Tris-甘氨酸c
1×:25mmol/L Tris
5×:15.1g Tris
250mmol/L 甘氨酸
94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3)
0.1% SDS
50mL 10% SDS(电泳级)
说明:
①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液,出现沉淀后则予以废弃。
以片都以1×TBE作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。
进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小, 故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×TBE以提供足够的缓冲容量。
②碱性电泳缓冲液应现用现配。
③Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。
3.凝胶加样缓冲液
缓冲液类型
6×缓冲液
贮存温度
Ⅰ
0.25%溴酚蓝
4℃
0.25%二甲苯青FF
40%(W/V)蔗糖水溶液
Ⅱ
0.25溴酚蓝
室温
0.25%二甲苯青FF
15%聚蔗糖(Ficoll400)
Ⅲ
0.25%溴酚蓝
4℃
0.25%二甲苯青FF
30%甘油水溶液
Ⅳ
0.25%溴酚蓝
4℃
40%(W/V)蔗糖水溶液
碱性加样缓冲液:
300mmol/L NaOH
6mmol/L EDTA
Ⅴ
18%聚蔗糖(Ficoll400)
4℃
0.15%溴甲酚绿
0.25%二甲苯青FF
使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:增大样品密度;以确保DNA均匀进入样品孔内;使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2.2倍,而与琼脂糖浓度无关。以0.5×TBF作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同,而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。在琼脂糖浓度为0.5%~1.4%的范围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。
选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料,因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。
4.各种pH值的Tris缓冲液的配制
各种pH值的Tris缓冲液的配
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