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分子动力学方法
(MD)
1.引言
什么是分子动力学方法(MD)?
确定论的模拟方法实际上在本书第一章介绍的的第
一个计算机模拟工作,即费米--巴斯塔--乌拉姆实
验中已经产生了. 但是在统计物理中所用的分子动
力学方法则产生于1957年. B.J.Alder等首先用此
方法研究了硬球气体的状态方程.
经典分子动力学方法就是通过直接数值解N个分子
的运动方程得到这些分子每个时刻的坐标与动量,
即相空间中的轨迹,从而用统计方法计算出多体系
统的宏观性质。
分子:微观客体 (不一定是分子).
运动方程:经典牛顿方程或哈密顿方程.
数值积分:欧拉法、龙格--库塔法、辛算法等.
相互作用:Lennard--Jones 势等.
初始条件:有序、无序等.
边界条件:周期性、全反射、漫反射等.
经典MD
平衡态MD
微正则系综 (NVE)
正则系综 (NVT)
等温等压系综 (NPT)
等焓等压系综 (NPH)
非平衡态 MD
量子MD (密度泛函分子动力学,第一原理计算)
MD与MC的比较
分子动力学方法实现了 Boltzmann 的统计力
学途径,而蒙特卡罗方法实现了 Gibbs 的统计力学
途径.
分子动力学方法可处理与时间有关的过程,因
而可处理非平衡态,是更有力的模拟方法,但计算
量大、占内存多、程序也较复杂;
蒙特卡罗方法则具有程序简单、占内存少的优
点,但难以处理非平衡态.
2.单粒子问题初值问题的数值解法
2.1.一个例子一维简谐振子
我们先通过简谐振子的例子看看如何用计算机数值解单粒子问题,
一维简谐振子的哈密顿量为
p 2 1 2
H kx
2m 2
初始条件为x(0), p (0) ,哈密顿量 (能量)为守恒量。
运动方程可用拉格朗日形式和哈密顿形式,等价,但计算方法有
区别,哈密顿形式对时间一阶导数:
dx H p
dt p m
dp H
kx
dt x
用数值积分计算在相空间中的轨道 (x(t), p (t))
方法是将微分变成差分,引入时间步子 h 作泰勒展
开 df
[f (t h) f (t)]/ h
dt
dx [x (t h) x (t)] p (t)
于是,哈密顿方程变为
dt h m
dp [p (t h) p (t)]
kx(t)
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