CN1-植物蛋白质组讲议(第一章).pptVIP

植物蛋白质组学; 第一章 导论 第二章 蛋白质提取与样品制备 第三章 双向凝胶电泳 第四章 电泳图谱的图像分析 第五章 生物质谱技术与蛋白质鉴定 第六章 蛋白质组研究中的定量方法 第七章 蛋白质相互作用和蛋白质芯片 第八章 蛋白质组技术在植物科学中的应用 ;第一章 导论;第一节 蛋白质组学研究的历史和背景; 20 世纪下半叶，以分子生物学为代表，生命科学通过对基因复制、转录、翻译及遗传密码的分析与破译，最终以统一生命世界各层次、生命科学各分支的“中心法则”的问世而集成。;可与产生原子弹的曼哈顿工程和人类登月阿波罗飞行任务相媲美，是当前国际生物学、医学领域内一项引人注目的工程，是人类自然科学史上最重大的研究项目之一，将推动整个生命科学的发展。;人类基因组计划的启动;人类基因组计划的发展;二000年六月二十六日克林顿宣布 人类基因组草图绘制完成;六国科学家组成的国家人类基因组中心主要研究比例;首个中国人基因组图谱绘制完成 ;人类基因组包括分布于人46条染色体的30,000～35,000个基因。 人类基因组计划最终目的是测定基因组的全部序列，弄清整个基因组的结构、功能及其表达产物，彻底了解人类生命活动本质。;人类基因组计划的具体任务可以概括为建立四张图谱 ;遗传图谱（genetic map）又称连锁图谱(linkage map)，它是以具有遗传多态性（在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因，在群体中的出现频率皆高于1%）的遗传标记为“路标”，以遗传学距离（在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率，1%的重组率称为1cM）为图距的基因组图。遗传图谱的建立为基因识别和完成基因定位创造了条件。;物理图谱;序列图谱;大规模基因组测序; ? 晚疫病病菌会损害马铃薯的叶子和根茎，它在１９世纪导致爱尔兰大面积马铃薯绝收，约有１００万人因此死亡，还有数百万人因这一病虫害移居海外。据估算，这一病菌目前仍给全球农业造成每年约６７亿美元的损失。 ? 一个国际科研小组(美英等多国研究人员)2009年9月９日发布报告说，他们完成了对马铃薯晚疫病病菌的基因测序。 ? 马铃薯晚疫病病菌基因测序结果显示，与同类生物相比，该病菌有大得出奇的基因图谱，其中７４％都是由重复出现的“转位子”(Transposon)组成。这是一个“疯狂”的比例，通常微生物基因图谱中有２５％的“转位子”就已经很多了。“转位子”是具有特定功能的基因片段，它可以自我复制并在基因序列中四处移动，晚疫病病菌正是靠这些“转位子”的作用侵害马铃薯。晚疫病病菌基因如此演化是为了保持一个庞大的“武器库”，便于迅速适应环境变化。 ? 一名马铃薯育种专家在评论上述成果时说，有时“好不容易费１５年时间培育出一种有抵抗力的新品种，晚疫病病菌却只用几年就把它打败”，现在掌握了该病菌的基因图谱和“武器库”特点，将有助于研发能有效对付它的基因手段。 　　;高等真核生物的开放阅读框架的确定；现有基因的识别技术只适用于原核生物或低等真核生物 生物基因组只能表达部分基因，而且表达的基因类型和程度随生物生存环境及内在状态有极大的差异 基因组计划无法告诉哪些基因在何时何地以何种程度表达 mRNA本身存在着贮存、运转、降解、翻译调控及产物的翻译后的修饰加工。 调控蛋白的化学修饰不仅改变了蛋白的立体结构还改变了蛋白功能调节的功能基础，基因编码测序无法预测 基因是遗传信息的源头，而功能蛋白是基因功能的执行体;;;O’Farrel PH与1975年发现了二维电泳技术 蛋白质图象分析系统与软件以及大规模样品处理系统开发技术 80年代出现的Hillenkamp发明的激光解吸质谱 ，Fenn设计的电喷雾质谱 建立了肽质量指纹图谱与肽序列标签等;第二节 蛋白质组学的概念、技术路线及国内外现状 一、概念 PROTEOME：PROTEin与genOME的杂合 蛋白质组学是研究活细胞内基因组编码的全部蛋白质功能的科学。它是功能基因组学的“中流砥柱” ，是联系基因组序列与细胞功能的重要学科。 Proteome包括了一个基因组、一种生物或一种细胞/组织所表达的全套蛋白质。 ? 一门交叉学科 物理学 数学 化学 计算机科学 生物信息学 ;二、蛋白质组研究的相关技术与技术路线 双向电泳技术、计算机图像分析与大规模数据处理技术和质谱技术被称为蛋白质组研究的三大基本支撑技术。 图象分析系统，如PDQUEST 、Image