基于高密度SNP芯片进行中国荷斯坦牛CNV检测.pptVIP

衷心感谢各位老师！ * College Animal Science Technology College Animal Science Technology * 基于高密度SNP芯片进行中国荷斯坦牛CNV检测 刘剑锋　张勤 中国农业大学动物科技学院 2010.8.17 一、研究背景 拷贝数变异是指与参照基因组比较，DNA片段缺失、复制、插入或复杂基因组重排区域大于1Kb至Mb的结构变异。 * * … * CNV在人类基因组上的研究 CNVs大约占有12%的区域 几千个基因存在拷贝数变异 SNP研究任何两个随机人类基因组都至少有0.1%的差异 ，CNVs研究为至少1% * CNV在人类基因组上的研究 2004年，lafrate等在5个人群39名没有亲缘关系的健康个体中发现255个位点包含CNVs ,平均长度150kb-425kb 2004年，Sebat等在20个没有血缘关系的个体中发现221个拷贝数变异，平均跨越465kb * CNV在人类基因组上的研究 2005年，Tuzun等比较两组不同种族的人类基因组序列，共发现241个CNVs,片断大小在8～40kb。 2008年，Hasin等通过3个不同祖先的25个个体检测嗅觉受体（OR）基因位点的CNVs。发现93个OR基因位点受到CNVs影响。 * * CNV在小鼠中的研究 2007年，Chris 等比较C