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相关生物信息学分析及软件的使用;方法;目的基因序列的检索;主要数据库介绍;;;NCBI介绍：NCBI建立在1988年,作为一种公共分子生物学信息资源, 而创建的公开数据库。 NCBI的计划：1.基本研究；2.数据库；3.软件的开发；4.教育和训练;现在我们以查找甘薯异戊烯氯喹异构酶（Ipomoea batatas isopentenyl diphosphate isomerase ，ipi）的 编码序列为例，介绍如何从ＮＣＢＩ中在线获取所需要的核酸序列．;1.进入;2.选择数据库;;;Genbank格式的序列记录;FASTA格式的序列记录;基因表达的ORF分析;　　aagcaagacg ccaagggcca aggctggctg caagaagcaa agaggaacga acactgtgaa 61 tatcccaatg tcgatgatgg cttctgttca aatctgtcgg agattctctc ccctagtcgc 121 ccggccggcg atttactctg ccaattcttc attcctctca ccagtctctt tcgcctcttc 181 ttctctttca attatgccga tccgcctccg ctgcagagct tcagtacact ctgtccgcgc 241 cgcctccacc atgggggaca ccatcactga tgccaacatg gatgctgtcc agcgccgcct 301 catgtttgac gacgagtgta ttttggtgga tgagaatgac cgtgttgttg gtcatgatac 361 caagtataat tgtcatctta tggagaagat tgaatctgag aatctgcttc acagagcttt 421 cagtgttttc ttatttaatt caaactatga gttgcttctt cagcaacgat ctgcgacaaa 481 ggtcaccttc cctttggtgt ggactaacac ctgctgcagc catcctctgt accgggagtc 541 tgagttgatt gaagagaatg ctcttggtgt gaggaatgct gcacaaagaa agcttcttga 601 tgaactgggg attcctgcag aggatgtccc agttgatgaa ttcacaacat tgggccgtat 661 cctgtataaa gcaccttctg atgggagatg gggagagcat gaacttgatt atcttctctt 721 cattgtgagg gatgttggca tgcacccaaa cccggatgag gttgcagatg ttaaatatgt 781 gaatagggaa cagctgaaag agatcttgag gaaagcaaat gctggagagg atggtataaa 841 gctttcccct tggttcagat tagtcgtcga aaatttcttg ttcaaatggt gggatcatgt 901 cgagaaaggc accctaatgg aagctgcaga tatgaaaacc attcacaagt tggcctaaac 961 agccattggc tgagcttttg ttaaaccctt acatctacca ttcacttaac tgagcaaaaa 1021 tatattctat ggtcttctgc ttagtttcat gcttcatgct tgaactttca agttttatgt 1081 tacttttggc tgttaggaac tagtaatata tgtgaacttg ctatcaaaaa aaaaaaaaaa 1141 aaaaaaaaaa aaaaa // ;基因表达的ORF分析;;;核酸序列的比对分析;对核酸序列的首要分析是联网进行序列的同源性分析，以便能够利用最新的数据库反映该序列是否是已知序列以及与已知序列同源性的高低。典型的分析是采用NCBI的BLAST软件对GENBANK中的非冗余数据库（non-redundant database,nr）进行查询。该数据库是对GENBANK、EMBL和DDBJ中去除所有相同核酸序列进行整合后所得到的最为全面的已知基因数据库，其中???包括了部分基因组的序列。;运行时联网至：/BLAST 　按照提示进行查询。;;;;;;;;;;;;PCR引物设计;PCR基本原理; 因此，引物设计是整个工作的基础和关键。;引物设计的原则;引物设计的原则;引物二聚体;引物二聚体;引物二聚体;发夹结构;引物设计的原则;引物设计的原则;