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第三章 核酸;核酸(nucleic acid)
是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。
;;核酸的发现和重要的相关研究;核糖和脱氧核糖 ;嘌呤碱和嘧啶碱
;;;;;核苷
嘌呤碱N9或嘧啶碱N1与核糖或脱氧核糖C1′通过N-β-糖苷键相连形成核苷或脱氧核苷。
;核苷酸
;;核苷酸的连接
核苷酸之间以3′, 5′-磷酸二酯键连接形成多核苷酸链,即核酸。;;二、DNA的结构;(二) DNA的二级结构--双螺旋结构
1 DNA双螺旋结构的研究背景
碱基组成分析
Chargaff规则:
(1) [A]=[T],[G]=[C];
(2)不同生物种属的DNA碱基
组成不同;
(3)同一个体的不同器官或
组织的DNA碱基组成相同。
(4)一种生物DNA碱基组成不随
生物体的年龄、营养状态或
环境变化而改变。;;碱基的理化数据分析
A-T、G-C以氢键配对较合理
DNA纤维的X-线衍射图谱分析
;1953年,Watson 和Crick提出了B型DNA双螺旋结构模型。
;2 DNA双螺旋结构模型的要点;;;(3)螺旋参数。DNA双链是右手螺旋结构螺旋直径2nm,每圈螺旋含10个碱基对(bp),螺距为3.4nm。
(4)螺旋表面。配对碱基并不充满双螺旋的全部空间,而且碱基对占据的空间不对称,因此在双螺旋的表面形成两条螺形凹沟,一条较深称为大沟(majorgroove),一条较浅称为小沟(minor groove)。
(5)维持双螺旋稳定的因素:横向为互补碱基间的氢键,纵向为碱基平面间的疏水性堆积力。磷酸基团上的负电荷与带正电荷的组蛋白或介质中的阳离子之间形成离子键;范德华力。(参见P92);;见P92; 3 DNA双螺旋结构的多样性化(自学);;见P76;(三) DNA的三级结构;正超螺旋(positive supercoil)
指左手方向的超螺旋, 增加螺旋圈数。
负超螺旋(negative supercoil)
指右手方向的超螺旋, 减少增加螺旋圈数。
生物体内多数超螺旋以负超螺旋的形式存在。
意义
DNA超螺旋结构整体或局部的拓扑学变化及其调控对于DNA复制和RNA转录过程具有关键作用。;真核生物染色体由DNA和蛋白质构成 (自学 )
其基本单位是核小体(nucleosome)。
核小体的组成
DNA:约200bp
组蛋白:H1、H2A,H2B、H3、H4;;;;;;DNA的功能;三、RNA的结构与功能;;(一) 信使RNA的结构与功能;见P84-85;* 真核生物mRNA结构特点;;5′帽结构的作用:
mRNA的帽结构可与帽结合蛋白(cap binding protein, CBPs)结合。
参与翻译的起始
保护mRNA免受RNase的水解
与mRNA从细胞核向细胞质转运有关。
3′末端多聚A尾结构的作用:
与mRNA 由核内向胞质的转位有关
增加mRNA的稳定性
参与翻译起始的调控;* mRNA的功能
把DNA所携带的遗传信息,按碱基互补配对原则,抄录并传送至核糖体,用以决定其合成蛋白质的氨基酸排列顺序。;(二) 转运RNA的结构与功能;* tRNA的一级结构特点
含10~20% 稀有碱基,如DHU
3′末端为—CCA-OH
5′末端大多数为G
具有TΨC;* tRNA的二级结构
——三叶草形
DHU环
反密码环
TΨC环
额外环
氨基酸臂
;;;(三) 核蛋白体RNA的结构与功能;;;rRNA的功能:
参与构成核蛋白体
核蛋白体是蛋白质合成的场所
为肽链合成所需要的mRNA、tRNA以及多种蛋白因子提供了相互结合的位点和相互作用的空间环境。
;见P397;;; 四、核酸的性质;OD260的应用;(二)DNA的变性(denaturation)
定义:在某些理化因素作用下,DNA双链互补碱基之间氢键断裂,双螺旋结构松散,解开成两条单链的过程。
DNA变性只改变其二级结构,而不改变其核苷酸序列。;;;方法:过量酸、碱,加热,
变性试剂如尿素、酰胺;
某些有机溶剂如乙醇、丙酮等。
变性后其它理化性质变化:
OD260增高 粘度下降
比旋度下降 浮力密度升高
酸碱滴定曲线改变 生物活性丧失
;;;见P93;Tm:变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称熔解温度(melting temperature, Tm)。; Tm就是DNA的热变性过程中,50%的DNA双链打开时的温度。
Tm值的高低与以下因素有关:
所含碱基中的
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