分子生物学课件-第十一章.ppt

第11章　基因组与比较基因组学 人类基因组计划 高通量DNA序列分析技术 人类基因组计划 美国政府决定于 1990年正式启动HGP，预计用 15 年时间，投入 30 亿美元，完成 HGP。由国立卫生研究院和能源部共同组成“人类基因组研究所”逐渐地，HGP 扩展为多国协作计划。参与者包括：美、英、日、法、德和中国。作为参与这个计划的唯一的发展中国家，我国于1999年加入该计划，承担其中1%的任务，即人类3号染色体短臂上约30Mb的测序任务虽然参加时间较晚，但是我国科学家提前两年于2001年8月26日绘制完成“中国卷”，赢得了国际科学界的高度评价。 。 最初希望2005年前能够获得人类DNA序列的图谱, 但是到1997年, 在耗费了巨额资金和一半预定时间之后，多国合作小组仅完成了3%的测序工作。 Craig Venter 创立了一个名为“Celera Genomics”的风险投资公司, 并宣称他将在无政府投资条件下早于多国合作小组完成人类基因组计划。 二000年六月二十六日克林顿宣布 人类基因组草图绘制完成  2001 年2月 人类基因组“精细图”完成(99%)Celera美国 Science, Vol. 291, No. 5507 多国合作小组 英国Nature , Vol.409, p.860各自独立的同时发表论文, 在2001年2月12日的记者招待会上联合宣布人类基因组测序工作的完成。  ２００３年４月１４日，人类基因组序列图亦称“完成图”（99.99%），提前绘制成功。 人类基因组包括23对染色体，单倍体细胞中约有30亿对核苷酸，编码2万～3万个基因，人类基因组中携带了有关人类个体生长发育、生老病死的全部遗传信息。 从整体上看，不同人类个体的基因是相同的，人类99．9％的基因密码是相同的，而差异不到0．1％，因此，我们说“人类只有一个基因组”，人生来是平等的。不同的人可能拥有不同的等位基因，这一点决定了人与人之间个体上的差异。 人类基因组研究的惊人发现 三、人类基因组计划的科学意义 p424 （1）确定人类基因组中约3万个编码基因的序列及其在基因组中的物理位置，研究基因的产物及其功能。 （2）了解转录和剪接调控元件的结构与位置，从整个基因组结构的宏观水平上理解基因转录与转录后调节。 （3）从整体上了解染色体结构，包括各种重复序列以及非转录“框架序列”的大小和组织，了解各种不同序列在形成染色体结构、DNA复制、基因转录及表达调控中的影响与作用。（4）研究空间结构对基因调节的作用。有些基因的表达调控序列与被调节基因从直线距离上看，似乎相距甚远，但若从整个染色体的空间结构上看则恰恰处于最佳的调节位置，因此，有必要从三维空间的角度来研究真核基因的表达调控规律。 （5）发现与DNA复制、重组等有关的序列。DNA的忠实复制保障了遗传的稳定性，正常的重组提供了变异与进化的分子基础。局部DNA的推迟复制、异常重组等现象则导致疾病或者胚胎不能正常发育，因此，了解与人类DNA正常复制和重组有关的序列及其变化，将对研究人类基因组的遗传与进化提供重要的结构上的依据。 （6）研究DNA突变、重排和染色体断裂等，了解疾病的分子机制，包括遗传性疾病、易感性疾病、放射性疾病甚至感染性疾病引发的分子病理学改变及其进程，为这些疾病的诊断、预防和治疗提供理论依据。 （7）确定人类基因组中转座子、逆转座子和病毒残余序列，研究其周围序列的性质。了解有关病毒基因组侵染人类基因组后的影响，可能指导人类有效地利用病毒载体进行基因治疗。 （8）研究染色体和个体之间的多态性。这些知识可被广泛用于基因诊断、个体识别、亲子鉴定、组织配型、发育进化等许多医疗、司法和人类学的研究。此外，这些遗传信息还有助于研究人类历史进程、人类在地球上的分布与迁移以及人类与其他物种之间的比较。 以人类基因组和拟南芥基因组为例说明你对生物基因组全序测定工作的科学意义与社会意义的认识（8分） 中国科学院2002年 硕士学位研究生入学分子遗传学试题 全序列图 人类基因组的核苷酸序列图是分子水平上最高层次、最详尽的物理图。测定总长约1米、由30亿个核苷酸组成的全序列是人类基因组计划中最明确、最艰巨的任务。 人类基因组计划 高通量DNA序列分析技术 Sanger 双脱氧链终止法 基本原理: DNA聚合酶的双脱氧链终止原理 ⑴DNA聚合酶能以单链DNA为模板，合成出准确的DNA互补链序列； ⑵如果以ddNTP（p417）为底物，掺入到新合成的寡核苷酸链的3‘端后，DNA链的延伸被终止，形成长短不一的核酸片段（长度相邻者仅差一个碱基） ⑶电泳分离长短不一的核酸片段，根据片段3’端的双脱氧碱基，便可依次阅读合成片段的碱基