间隔区寡核苷酸分型和多位点可变数量串联重复序列分析在结核分枝.PDFVIP

·268· ·实验研究· 间隔区寡核苷酸分型和多位点可变数量 串联重复序列分析在结核分枝杆菌基因 分型中的应用 董海燕 刘志广 赵秀芹 阳波 万康林 【摘要】 目的评价间隔区寡核苷酸分型(spoligotyping)及多位点可变数量串联重复序列分析 (MLvA)方法在结核分枝杆菌基因分型研究中的应用。方法收集224株结核分枝杆菌临床分离 株，分别采用Sp01igotyping及MLvA方法进行基因分型，比较两种方法的分型效果，评价两种方法在 结核分枝杆菌基因分型中的应用。结果使用spOligotyping方法，224株结核分枝杆菌呈现出55种 基因型，39株具有独特的基因型，其余185株菌呈现出16种基因型；使用MLVA方法时，224株结核 分枝杆菌呈现出160种基因型，132株具有独特的基因型，余下的92株菌呈现出28种基因型；当两种 方法联合使用时，224株结核分枝杆菌呈现出179种基因型，159株结核分枝杆菌具有独特的基因型， 余下的65株菌表现为20种基因型。湖南省和安徽省的菌株中北京家族菌株所占的比例差异有统计 学意义(P0．001)，安徽省北京家族菌株所占的比例明显高于湖南省。结论MLVA在结核分枝杆 菌株水平的鉴定方面，其分辨能力高于spoligotyping，但是Sp01igotyping在鉴定北京家族菌株和 M．60可如方面有一定的优势。将Spoligotyping方法作为一线分型技术，MLVA作为二线分型技术联 合应用时，将提高结核病的流行病学调查和病原学监测效果。不同地区的菌株有不同的特点。 【关键词】 结核分枝杆菌；间隔区寡核苷酸分型；可变数量串联重复序列；基因分型 of andMLVA in studies n16ercHZDs妇 genotype of^枷6口cfP，fHm ApplicationSpoligotyping analysis Bo，WAN K口”g—Z锄．S抛地K倒L幻m￡o删 Do『、临HⅡi一粥n，LJU乃i—g“Ⅻg，ZHAo弼“一咖n，yANG Dis∞s8 Dis∞s已(乃行￡roZ口行d ／brj粗／砧fio“s P，℃t肥挖fio胛口行d(为咒￡，_0Z，N以￡面卵口Z，以sfif“把，br(力，咒，咒M咒icⅡ6￡F Di5阳59CD靠￡roZ。托d 102206，China P卵御卵fio卵，C辅i卵聊C删￡Pr如r P埘w规￡如押，BP巧i咒g CDr，‘酊po打dj打g口“f^or：W4卜fK以理{}Zi卵，Email：wankanglin@icdc．cn Toaccessthe of 【Abstract】Objective applicationspaceroligotyping(sp01igotyping)andMultiple t“6已M“Zos如．Methods224clinical Locus studiesofⅣhr060c招ri“m VNTR(MLVA)inepidemiological iSolatesofM．f“68rf“Z∞妇were∞1lectedand andMLVA typedbySpoligotypingrespectively，tocompare their in studiesofM．￡M6已，℃“Zosi5． theresultsofbothmethodsandtoaccess applicatiQnepidemi0109ical