黄口荔枝螺转录组数据的微卫星标记开发与分析-海洋科学.PDFVIP

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2019-05-18 发布于天津
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黄口荔枝螺转录组数据的微卫星标记开发与分析-海洋科学.PDF

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黄口荔枝螺转录组数据的微卫星标记开发与分析 1 1 2 1 1 李威 , 赵姗 , 焦海峰 , 林志华 , 包永波 (1. , 315100; 2. , 315100) 摘要: 以黄口荔枝螺转录组测序所得到的拼接序列为基础, 利用 MISA 软件进行微卫星分析, 利用 Primer5.0 设计引物 160 对。结果显示, 83 对引物能够成功扩增, 引物在黄口荔枝螺渔山列岛群体多态性检测中发现, 37 个 SSR 位点能够表现出多态性, 一共获得了 129 个等位基因, 各位点等位基因数为 2~5 个, 平均每个位点等位基因数为3.49 个, 观测杂合度H , 期望杂合度H , 多态信息含量PIC 范围 o e 分别介于0.000~0.800 、0.146~0.645 、0.139~0.573 之间, 有 9 个表现为高度多态, 20 个表现为中度多态, 8 个表现为低度多态。实验结果进行Hardy-Weinberg 平衡检测后, 利用Bonferroni correction 法进行校正, 有29 个位点显著偏离, 结果表明渔山列岛黄口荔枝螺群体总体遗传多样性水平较低。关键词: 黄口荔枝螺; 转录组; 微卫星; 遗传多样性中图分类号: S 917.4 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2015)11-0061-07 doi: 10.11759/hykx20150616002 (Thais luteostoma) , “”, , 20 m 1 材料和方法 [1] 1.1 实验样品采集与DNA 的提取 , , , ; (28°53.3′N, 122°16.5 ′E), , , , [2] , , , 23.06 mm, 16.98mm, 30 , , –20 ℃ , , - DNA, 1% DNA , DNA [3-7], , DNA 100 ng/μL, PCR (simp