黄河流域大鳞副泥鳅遗传多样性研究-遗传学专业毕业论文.docxVIP

摘要大鳞副泥鳅(Paramisgurnus 摘要 大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)属鲤形目、鳅科、副泥鳅属，广布于中国、 日本和东南亚等国家，具有重要的使用价值和药用价值。我国每年都出口大量的大鳞副 泥鳅，日本、韩国需求量较大。然而随着大鳞副泥鳅资源的进一步深入开发，再加上自 然水域环境受到人为的破坏，大鳞副泥鳅的生产量逐年下降。如何合理开发和保护我国 现有大鳞副泥鳅资源己成为维护其产业可持续发展的关键。 本研究通过对黄河流域不同地区大鳞副泥鳅线粒体的12S rRNA、16S rRNA、C01 基因片段的PCR扩增、序列测定和软件分析，从序列变异和遗传多样性、种群遗传结 构和系统地理以及种群动态三个方面进行分析。希望能为今后的资源保护及其渔业管理 提供理论依据。 大鳞副泥鳅12S rRNA基因片段长度为398bp，在28个个体中检测到7个单倍型，总 群体单倍型多样性指数(HD)0．442，核苷酸多样性指数(Pi)O．00214，平均核苷酸差 异数(K)0．849；16S rRNA基因片段长度为621bp，在32个个体中检测到16个单倍型， 总群体单倍型多样性指数(HD)0．847，核苷酸多样性指数(Pi)0．00683，平均核苷酸 差异数(K)3．530；C01扩增片段长度为655bp，检测的28个个体中共获得14个单倍型， 单倍型多样性指数(H)为0．757，平均核苷酸多样性指数(Pi)达0．0032，平均核苷酸差异 数(K)2．108。16S rRNA与C01对大鳞副泥鳅遗传多样性的检测高于12S rRNA的检 测。 对3个群体的遗传结构进行检测表明，黄河流域大鳞副泥鳅群体不存在显著的群体 分化。三群体间12S rRNA分化系数Fst达0．07645(p0．01)，基因流为6．0402：AMOVA 检测显示92．36％的遗传差异存在于群体内部，7．64％的遗传差异存在于群体间。对于16S rRNA，三群体间分化系数Fst达0．15576(p0．01)，基因流为31．6007；AMOVA检测 显示84．42％的遗传差异存在于群体内部，15．58％的遗传差异存在于群体间。C01--群体 间分化系数Fst达0．08349(p0．01)，基因流大于4。AMOVA检测显示91．65％的遗传 差异存在于群体内部，而8．35％的遗传差异存在于群体间。三地区大鳞副泥鳅交流较为 充分。聚类分析和单倍型网络关系图证实黄河流域山西临汾，河南新乡及山东济南三地 区大鳞副泥鳅群体并无显著地理分化，且享有共用单倍型。 Arlequm3．11软件计算的黄河流域大鳞副泥鳅三群体中三种分子标记的T旬ima’S Arlequm3．11软件计算的黄河流域大鳞副泥鳅三群体中三种分子标记的T旬ima’S D 和Fu’s FS值不统一，黄河流域三群体大鳞副泥鳅是否种群扩张有待进一步研究。 由此我们总结为：我国黄河流域大鳞副泥鳅的遗传多样性为高的单倍型多样性与低 的核苷酸多样性；种群间出现了遗传分化但并未达到种的分化；各地理群体间存在着广 泛的基因交流，不存在显著的地理差异；无种群扩张趋势。山东济南的遗传变异较山西 临汾和河南新乡的变异高。 关键词：大鳞副泥鳅，12S rRNA，16S rRNA，COI，遗传多样性 II AbstractParamisgurnus Abstract Paramisgurnus dabryanus，which belong to Cypriniformes order，Cobitidae family，Cobitinae genus， is widely distributed in China，Japan and Southeast Asia，showing important economic and medicinal values．Large quantities of Paramisgurnus dabryanus was exported from China to Japan and Korea every year．However，with environment deferioration，Paramisgurnus dabryanus’production is declining· Resource development and protection become the key to maintain the sustainable development of Paramisgurnus dabryanus The gene fragments of Paramisgurnus dabryanus’1 2S rRNA．1 6S rRNA and CO 1 sequence