染色质免疫共沉淀分析丁酸钠对酌珠蛋白基因启动.pdf

窑1222窑 南方医科大学学报(JSouthMedUniv) 2010;30(6) 染色质免疫共沉淀分析丁酸钠对酌珠蛋白基因启动子组蛋白乙酰化的作 用 1 1 1 2 1 2 陈剑锋 袁钱新华 袁赵丹华 袁千新来 渊 南方医科大学南方医院新生儿科袁广东广州 510515曰 新乡医学院病理 学教研室袁河南 新乡 453003冤 摘要院目的 建立基于Real-timePCR分析的染色质免疫共沉淀渊ChIP冤方法袁探讨丁酸钠对酌-珠蛋白基因启动子区组蛋 7 白乙酰化的作用遥 方法 将K562 细胞分为0.5mmol/L 丁酸钠处理48h组和K562 细胞组袁每组取 1伊10 细胞用实验遥 采用抗乙酰化组蛋白H3及H4抗体分别对两组细胞进行ChIP袁 荧光定量PCR分析不同处理细胞G酌-尧A酌-珠蛋白基 因启动子区乙酰化H3 和H4渊acH3,acH4冤水平遥结果 各细胞组组内G酌- 和A酌-珠蛋白基因启动子区域acH3尧acH4水 平高于阴性对照necdin基因遥 与K562 细胞相比袁NaB 处理组G酌-珠蛋白基因启动子区acH3 和acH4水平分别升高 3.1和2.6倍袁A酌-珠蛋白基因启动子区acH3 和acH4水平分别升高3.7和3.2倍渊P0.01冤遥 结论 建立了基于荧光定量 PCR分析的ChIP技术用于研究珠蛋白基因启动子区域组蛋白的表观遗传修饰袁 并进一步证实了丁酸钠对酌-珠蛋白 基因启动子区域组蛋白乙酰化的作用遥 关键词院染色质免疫共沉淀曰丁酸钠曰酌-珠蛋白基因曰组蛋白曰乙酰化 中图分类号院R331 文献标识码院A 文章编号院1673-4254(2010)06-1222-04 Effectsof sodium butyrateon acetylation of histone in 酌-globin gene promoter regions in K562cells:astudyusingchromatinimmunoprecipitation 1 1 1 2 CHENJian-feng ,QIANXin-hua ,ZHAODan-hua ,QIANXin-lai 1 2 DepartmentofNeonatology, NanfangHospital, SouthernMedicalUniversity, Guangzhou510515, China; DepartmentofPathology, XinxiangMedicalCollege,Xinxiang453003,China Abstract: Objective Todevelopareal-timePCR-basedchromatinimmunoprecipitation (ChIP) assayfordeterminingthe effectofsodiumbutyrateonacetylationofhistonein酌-globingenepromoterregionsinK562cells.Methods K562cellswere 7 growninthepresenceorabsenceof0.5mmol/Lsodiumbutyratefor48h, and1伊10 cellspergroupwereusedforreal-time PCR-basedChIPwithanti-a