蛋白质的物理化学性质课件.pptVIP

4.蛋白质折叠研究意义及应用前景 ※蛋白质折叠研究意义 蛋白质折叠机制的阐明有助于揭示生命体内第二套遗传密码的理论意义。 最终阐明遗传信息传递的全过程，完全建立分子生物学的中心法则。 精品 应用前景 （1）对包涵体的复性有重要帮助 （2）DNA重组和多肽合成技术的发展使我们能够按照自己的意愿设计较长的多肽链 （3）深入了解蛋白质折叠与错误折叠的关系对于这些疾病的致病机制的阐明以及治疗方法的寻找将大有帮助 （4）蛋白质折叠机制的阐明是我们对于蛋白质相互作用、配体与蛋白质的作用等结构与功能关系研究的基础 （5）提高蛋白质结构预测的可靠性 精品 第三节 蛋白质折叠热力学与动力学 蛋白质折叠内容： （1）变性的蛋白质或多肽链的折叠 （2）通过三联密码翻译成的氨基酸序列链(新生肽链) 的折叠 蛋白质折叠的研究方法 （1）X-射线晶体衍射 （2）同源模建方法 （3）从蛋白质序列出发，直接预测蛋白质的结构？ 精品 一、蛋白质折叠的热力学研究 Anfinsen认为,蛋白质的折叠结构在一定条件下是热力学最稳定的,即通常的自由能极小的状态。 环境条件不同，热力学平衡移动的方向就不同，可以向天然态方向移动，也可以向退折叠方向移动，就有了平衡态的折叠和退折叠转变过程。 通过熵函数和吉布斯自由能,简要分析蛋白质折叠结构中所蕴涵的热力学基本原理 精品 典型的蛋白质的折叠漏斗（引自Patricia L. Clark） 能 量 未折叠状态 中间状态 天然状态 蛋白质折叠研究的漏斗模型 精品 1.熵效应 熵增加原理：在绝热条件下，体系发生不可逆过程时，其熵值增大；而体系发生可逆过程时，其熵值不变；不可能发生熵值减小的过程。 疏水作用的主要动力来自于蛋白质溶液体系的熵增效应。 例如,疏水作用是肌红蛋白多肽链折叠的主要驱动力, 使水介质中球状蛋白质的折叠总是倾向于把疏水残基隐藏在分子的内部，其在稳定蛋白质的三维结构方面占有突出的地位。 精品 2.吉布斯自由能变化 ※ ΔG总=ΔH链+ΔH溶剂- TΔS链- TΔS溶剂 ※ 折叠态蛋白质与伸展态相比，是一种高度有序化的结构，因此ΔS链是负数，则-TΔS链为正值。 ※ 折叠态蛋白质中疏水侧链主要是通过范德华力彼此相互作用。 ※ 对于典型的蛋白质来说，对折叠结构的稳定性做出单项最大贡献的是疏水残基引起的ΔS溶剂。 精品 3．折叠/退折叠转变 蛋白质折叠归根结底取决于在某温度（T）下折叠态（F）和伸展态（U）之间的吉布斯自由能差（△G）： ΔG=GF－GU=ΔH－TΔS=（HF－HU）－T（SF－SU） 在伸展态中多肽主链及其侧链是与溶剂水（也称介质水或环境水）相互作用的，因此折叠时自由能变化（△G）的任何测量必须考虑多肽链和溶剂两者对焓变化（△H）和熵变化（△S）的贡献： ΔG总=ΔH链＋ΔH溶剂－TΔS链－TΔS溶剂 极性侧链?H链是正值，而?H溶剂是负值。对蛋白质的极性侧链来说，?G总接近于零，对蛋白质折叠不作实质性的贡献。 精品 蛋白质 条 件 ? G/(kJ·mol-1) ?H/(kJ·mol-1) ?S/( J·k-1·mol-1) 核糖核酸酶A pH2.5 -7.3 -238 -774 胰凝乳蛋白酶 pH3.0 -32 -163 -439 肌红蛋白 pH9.0 -57 -157 -397 β-乳球蛋白 5mol/L尿素 -1.7 +88 +301 几种蛋白质折叠的热力学数据 ※ 在不同蛋白质中总熵变化（ΔS链+ΔS溶剂）和总焓变化对折叠结构的稳定性所做的贡献的份额是不同的 精品 四、蛋白质构象与热运动 构象:由于单键基本自由旋转以及键角有一定的柔性，一种具有相同结构和构型的分子在空间里可采取多种形态，分子所采取的特定形态称为构象。 构象角:围绕单键旋转的角度称为构象角,它决定了多肽链的一个结构 。 精品 热运动:是指蛋白质溶液中所有分子的不停运动，包括了分子相对于容器的运动和分子内部各部分之间的相对运动。 热运动在溶液中和多肽链的各部分之间传播，主要是通过多肽链各部分之间和多肽链与溶液分子之间的相互作用来实现的。 体系达到热力学平衡时，在空间的一定范围内和一定间隔内的平均热运动能量不再发生变化，蛋白质处于天然态 。 精品 五、热力学参数在分子水平上的解释 从分子的相互作用来理解蛋白质天然结构的稳定性 为了使蛋白质折叠起来，就需要通过多肽链各部分间相互作用所引起的内能的减少来抵消构象熵减少带来的自由能增加。 G=H-TS=E+pV-TS 精品 键