中国近海大型底栖动物DNA条形码的研究进展.PDFVIP

中国近海大型底栖动物DNA 条形码的研究进展 1, 2, 3 1, 2, 3, 4 1, 2, 3, 4 杨 梅 , 寇 琦 , 李新正 (1. 中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室, 山东 青岛 266071; 2. 中国科学院海洋大科学 研究中心, 山东 青岛 266071; 3. 青岛海洋科学与技术国家实验室 海洋生物学与生物技术功能实验室, 山东 青岛 266237; 4. 中国科学院大学, 北京 100049) 摘要: DNA 条形码是利用标准的、变异率适度、易于扩增且相对较短的DNA 片段对物种进行快速准 确鉴定的技术。海洋大型底栖动物分布广泛, 具有多样性、复杂性和趋同性等特点, DNA 条形码技术 能够在传统分类学基础上对物种进行快速、准确地鉴定。本文概述了 DNA 条形码技术在中国近海大 型底栖动物研究中的发展现状, 如多孔动物(Porifera) 、刺胞动物(Coelenterata) 、多毛动物(Polychaeta) 、 软体动物(Mollusca) 、甲壳动物(Crustacea) 、棘皮动物(Echinodermata)等, 介绍了该技术在物种鉴定、 隐存种发现、生物多样性评估等领域的研究进展, 指出了目前条形码技术在应用中的局限性, 并对未 来的研究工作进行了展望。 关键词: 大型底栖动物; DNA 条形码; 分类学; 物种鉴定 中图分类号: Q959 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2018)10-0163-11 DOI: 10.11759/hykx20180726002 中国海是东半球西北太平洋低、中纬度的边缘 学研究团队规模有限, 且海洋生物所具有的表型可 海, 跨越三个气候带, 拥有多种类型的海岸、河口、 塑性、种内性别二态性及不同种间趋同进化等特点 岛屿及海底地形地貌, 海洋生物区系种类丰富[1], 目 导致隐存种属普遍存在, 使得传统形态学鉴定方法 前已知的大型海洋生物就达2.5 万种之多[2] 。海洋底 存在诸多局限[3] 。分子生物学技术的不断创新为分类 栖生物(macrobenthos)指在从潮间带到海底的表面和 学的发展提供了新的机遇, 2003 年加拿大学者 Hebert 沉积物中营底栖生活的所有生物[3] 。海洋底栖生物以 等[6]提出利用线粒体细胞色素 c 氧化酶亚基 I(COI) 海洋沉积物底内、底表及水中物体(包括生物体和非 基因序列的多态性, 能够实现DNA 水平上物种的区分, 生物体)为依托而生存, 从潮间带至海洋深渊均有分 DNA 条形码(DNA barcoding)技术应运而生。 布, 是海洋生态系统中数量最多, 生态关系最复杂 DNA 条形码技术是利用一段标准的、变异率适 的类群[4] 。海洋大型底栖动物(Macrozoobenthos)是指 度、易于扩增且相对较短的DNA 片段对物种进行快 在样品分选时不能通过孔径为0.5 mm 网筛的底栖动 速准确的鉴定, 实现物种和DNA 序列间一一对应的 物[4] 。大型底栖动物所属门类主要包括多孔动物 关系。要求DNA 条形码在种间的遗传变异明显大于