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《系统生物学》课程教学大纲
刘笔锋、杜伟
一、课程名称：系统生物学 Systems Biology
二、课程编码：0703032
三、学时与学分：32/2
四、先修课程：分子生物学、细胞生物学、生物化学、系统科学概论、自动控制原理
五、课程教学目标
1．帮助学生了解系统生物学，在分子细胞生物学和系统理论的基础上进一步探讨生物系统的工作方式；
2．使学生了解并掌握系统生物学研究的实验技术平台；
3．使学生了解如何实现系统的控制和设计。
六、适用学科专业
生物医学工程、生物信息技术
七、基本教学内容与学时安排
●系统生物学概述（2学时）
●先进系统测量平台：（6学时）
基因组技术平台
转录组技术平台
蛋白质组技术平台
代谢组技术平台
●基于基因表达数据的逆向工程与数据挖掘（6学时）
基于DBRF方法从大规模稳态基因表达数据推测基因网络
癌症关联的基因表达矩阵分析
基于遗传规划方法从观测数据到代谢通路的自动逆向工程
●模拟与仿真软件（6学时）
系统生物学工作平台
信号转导自动模型的生成及在MAP激酶途径中的应用
功能基因组学数据的大型生物系统建模
●细胞仿真（6学时）
虚拟生物实验室
计算细胞生物学—随机方法
细胞的计算机仿真
●系统水平的分析（6学时）
构建生物信号转导途径的数学模型-鲁棒性分析
动态平衡和信号转导中普遍存在的调节机制
Rho激酶途径和肌球蛋白轻链激酶途径在肌球蛋白轻链磷酸化中的不同作用-动力学仿真研究
八、教材及参考书
《Foundation of Systems Biology》Hiroaki Kitano
九、考核方式
程序＋报告＋开卷考试
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