基于Illumina测序技术挖掘Bt杀虫基因资源.docxVIP

基因组学与应用生物学，2014 年，第 33 卷，第 3 期，第 472-477 页 Genomics and Applied Biology, 2014, Vol.33, No.3, 472-477 研究论文 Research Article 基于 Illumina 测序技术挖掘 Bt 杀虫基因资源 张文飞 1 吴红萍 1 徐志霞 1 金映虹 1 吴仲琦 1 钤江朝 1 黄楠楠 1 金文杰 1 贾璐羽 1 栗新峰 1 王宁 1 赵丛 2 刘肖静 1 刘洁 1 刘明月 1 刘义凤 1 王锐萍 1 * 1 热带动植物生态学省部共建教育部重点实验室, 海南师范大学生命科学学院, 海口, 571158; 2 海南省热带农业资源研究所, 三亚, 572025 通讯作者, wrp@ 摘 要 苏云金芽孢杆菌作为应用最为广泛的生物农药，已经成为化学合成农药必要的补充或替代品，其杀 虫蛋白基因已成功的应用到转基因抗虫作物中。本文基于海南五指山和吊罗山热带原始雨林区土壤样品筛 选分离的 Bt 菌株资源，利用第二代测序技术 Illumina 对分离的特异 Bt 菌株的杀虫基因进行全面分析，鉴定 出新型 Bt 杀虫蛋白基因 25 个，其中包括 5 个新型的营养期杀虫蛋白基因(vip)和 3 个新型 cyt 基因。本研究 表明第二代 DNA 测序技术可以高效用于挖掘 Bt 杀虫基因资源，而获得的新型杀虫蛋白基因将进一步丰富 我国能够应用的杀虫基因种类。 关键词 Illumina 测序, 苏云金芽孢杆菌, 杀虫蛋白 Mining New Bt Insecticidal Protein Genes Resource Using Illumina Se- quencing Technology Zhang Wenfei 1 Wu Hongping1 Xu Zhixia 1 Jin Yinghong1 Wu Zhongqi 1 Qian Jiangzhao 1 Huang Nannan 1 Jin Wenjie 1 Jia Luyu 1 Li Xinfeng 1 Wang Ning 1 Zhao Cong 2 Liu Xiaojing 1 Liu Jie 1 Liu Mingyue 1 Liu Yifeng 1 Wang Ruiping 1* 1 Ministry of Education Key Laboratory for Tropical Animal and Plant Ecology, College of Life Sciences, Hainan Normal University, Haikou, 571158; 2 Hannan Institude of Tropical Agricultural Resource, Sanya, 572025 Corresponding author, wrp@ DOI: 10.13417/j.gab.033.000472 Abstract Bacillus thuringiensis (Bt), as the most widely used biologically produced pest control agent, is already a useful alternative or supplement to synthetic chemical pesticide and is also a key source of genes for transgenic ex- pression to provide pest resistance in plants. On basis of Bt strains isolated from soil samples from the Diaoluoshan and Wuzhishan Natural Reserve, we carried out a large-scale screening the insecticidal genes from the special Bt strains through Illumina sequencing. In this study, 25 of the insecticidal genes, including 5 of the novel vegetative in- secticidal protein genes