原理:将分离群体(F2、BC、DH)中的个体依据目标性状(如抗病、感病)分成两组,在每一组中将若干个体DNA等量混合,形成两个DNA混合池(如抗病池和感病池)。由于分组时仅对目标性状进行选择,因此两个池之间理论上就应主要在目标基因区段存有差异,也称近等基因池法(Isogenic DNA pool) 。 优点:克服了许多作物没有或难以创造相应NILs的限制(Michelmore等1991)。 集群分离分析法 (Bulked Segregation Analysis) 1991年,Michelmor RW等首次利用集群分离分析法在没有近等基因系的条件下,通过对F2分离群体进行RAPD分析,寻找与靶基因连锁的RAPD标记的方法。他们从100个引物中找出3个与莴苣Dm基因连锁的RAPD标记。 目前F2集群分离分析法在基因定位中已被广泛应用 。如:莴苣抗霜霉病基因、水稻抗瘿蠓基因水稻抗稻瘟病基因、水稻耐黄丛卷叶病毒病基因等。 产量、品质、熟期等大多数重要农艺性状,均表现数量性状的遗传特点,受许多数量基因座位(Quantitative Trait Loci, QTLs)和环境因子的共同作用。 数量遗传学无法确定控制数量性状的QTLs数目,也无法确定单个QTL的遗传效应及染色体位置。 分子连锁图谱的发展,可以实现对单个QTL遗传效应的追踪,从而应用于分子标记辅助选择。目前已发展了QTLs定位
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