宏基因组方法比较分析深海和珠江口沉积物中抗生素耐药基因的特征.PDFVIP

第５６卷　第２期 中山大学学报 （自然科学版） Ｖｏｌ５６　Ｎｏ２ 　 ２０１７年　３月 ＡＣＴＡ　ＳＣＩＥＮＴＩＡＲＵＭ　ＮＡＴＵＲＡＬＩＵＭ　ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＡＴＩＳ　ＳＵＮＹＡＴＳＥＮＩ Ｍａｒ　２０１７　 ＤＯＩ：１０１３４７１／ｊｃｎｋｉａｃｔａｓｎｕｓ２０１７０２０１８ 宏基因组方法比较分析深海和 珠江口沉积物中抗生素耐药基因的特征 １，２ ３ ２ ４ ４ １ 林岚 ，林琳 ，陈恩中 ，陈保卫 ，王晓玮 ，陈清 （１．南方医科大学公共卫生学院，广东广州５１０５１５； ２．南方医科大学珠江医院，广东广州５１０２８２； ３．中山大学孙逸仙纪念医院，广东广州５１００２０； ４．中山大学海洋学院，广东广州５１０２７５） 摘　要：细菌对抗生素的耐药性是全球关注的环境健康问题之一。该研究旨在使用宏基因组方法比较分析西太 平洋深海和珠江口沉积物中抗生素耐药基因，认识抗生素使用与环境细菌耐药性间的关系。研究发现，深海沉 积物多重耐药基因的含量高达７７８％；珠江口沉积物多重耐药基因只有２７２％，常用抗生素的耐药基因 （磺胺 类、大环内酯类、氨基糖苷类等）含量明显提高 （约７０％）。沉积物中共发现４５种耐药基因亚型，其中７种基 因亚型 （ａｃｒＢ、ａｍｒＢ、ｂａｃＡ、ｃｅｏＢ、ｍａｃＢ、ｍｅｘＢ和ｓｍｅＥ）能在所有沉积物中发现。深海沉积物中质粒仅携带 ０３％的耐药基因，而珠江口沉积物则超过４０％。研究表面，由于珠江口周边区域常用抗生素的广泛使用，其沉 积物中细菌抗生素耐药性明显提高、耐药机制趋于多样化。 关键词：抗生素耐药基因；宏基因组分析；沉积物；西太平洋；珠江口 中图分类号：Ｒ１１　　文献标志码：Ａ　　文章编号：０５２９－６５７９（２０１７）０２－０１１２－０５ Ｍｅｔａｇｅｍｏｍｉｃａｎａｌｙｓｉｓｏｎｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ ｇｅｎｅｓｉｎｔｈｅｄｅｅｐｏｃｅａｎａｎｄＰｅａｒｌＲｉｖｅｒＥｓｔｕａｒｙｓｅｄｉｍｅｎｔｓ １，２ ３ ２ ４ ４ １ ＬＩＮＬａｎ ，ＬＩＮＬｉｎ，ＣＨＥＮＥｎｚｈｏｎｇ，ＣＨＥＮＢａｏｗｅｉ，ＷＡＮＧＸｉａｏｗｅｉ，ＣＨＥＮＱｉｎｇ （１ＳｃｈｏｏｌｏｆＰｕｂｌｉｃＨｅａｌｔｈ，ＳｏｕｔｈｅｒｎＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１０５１５，Ｃｈｉｎａ； ２ＺｈｕｊｉａｎｇＨｏｓｐｉｔａｌｏｆＳｏｕｔｈｅｒｎＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１０２８２，Ｃｈｉｎａ； ３ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＲｅｓｐｉｒａｔｏｒｙＤｉｓｅａｓｅ，ＳｕｎＹａｔｓｅｎＭｅｍｏｒｉａｌＨｏｓｐｉｔａｌ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１００２０，Ｃｈｉｎａ； ４．ＳｃｈｏｏｌｏｆＭａｒｉｎｅＳｃｉｅｎｃｅ，ＳｕｎＹａｔｓｅｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ５１０２７５，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｉｓｏｎｅｏｆｔｈｅｍｏｓｔｉｍｐｏｒｔａｎｔｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌｉｓｓｕｅｓｉｎｔｈｅｗｏｒｌｄ．Ｔｈｅｒｅｌａ ｔｉｏｎｓｈｉｐｂｅｔｗｅｅｎａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｕｓｅａｎｄａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｏｆｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌｂａｃｔｅｒｉａｗｅｒｅｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄｕｓｉｎｇ ｍｅｔａｇｅｎｏｍｉｃａｎａｌｙｓｉｓｏｆａｎｔｉｂｉｏｔｉｃｒｅｓｉｓｔａｎｃｅｇｅｎｅｓ（ＡＲＧｓ）ｉｎｔｈｅｓｅｄｉｍ