微生物的具体分类.pptVIP

80年代以前螺菌属(Spirillum)不同种的G+C含量范围宽达38～66%， 后来“伯杰氏手册”(1984)结合其他特征已将其分成三个属：螺菌属、 海洋螺菌属(Oceanospirillum)和水螺菌属(Aquaspirillum) 它们G+C含量分别为38%、42～51%和49～66%； 过去根据形态学特征曾认为微球菌属(Micrococcus)和葡萄球菌属 (Staphylococcus)是关系很近的两个属，因而长期放在一个科内， 由于G+C含量的差异(分别为30～38%和64～75%)表明它们亲缘关 系相当远，现在根据16SrRNA序列资料已进行新的调整。 G+C含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项 基本特征，它对于种、属甚至科的分类鉴定有重要意义。 疑难菌株鉴定、 新种命名、 建立一个新的分类单位、 G+C含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。 2. 核酸的分子杂交 不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关系就越近，反之亦然。 直接分析比较DNA的碱基排列顺序 ------由于技术上的困难目前尚难以普遍地进行； 核酸分子杂交(hybridization)间接比较不同微生物 DNA碱基排列顺序的相似性 五、噬菌体分型 噬菌体对宿主的感染和裂解作用常具有高度的特异性，一种噬菌体往往只能感染和裂解某种细菌，甚至只裂解种内的某些菌株。 追溯传染病来源、流行病调查、病原菌检测鉴定、工业上防噬菌体污染 鼠疫耶尔森氏菌(Yersinia pestis)噬菌体已被用于对该菌的快速鉴定。 金黄色葡萄球菌引起的流行病的调查中，噬菌体分型也发挥了作用。 六、生态特性 微生物和其他生物的共生和寄生关系，及微生物在自然界的分布情况 七、其它 氨基酸顺序和蛋白质分析、对细胞壁等细胞成分的分析比较、通过原核生物的转化、转导、接合来判断原核生物的亲缘关系等等。 第十一章 微生物的分类鉴定 教学内容 1.了解分类的单元 2.掌握微生物的命名方法 3.了解微生物的分类系统 4.了解微生物的鉴定 分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。 (根据现有数据建立系统的过程) 分类学涉及三个相互依存又有区别的组成部分： 鉴定 分类、 命名、 命名(nomenclature)：根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称； (分类系统建立过程中的步骤之一) 鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 (根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程) 主要以细菌为例介绍微生物分类、命名和鉴定的有关知识 界 门 纲 目 科 属 种 第一节 分类单元 一.微生物分类单元及等级 根据Carl Woese的理论，现在还在界之上使用 域(domain) （把全部生物先分为 古生菌域、细菌域和 真核生物域，域下面 再分界。） 二.种的定义 种又称物种，是微生物分类学最基本的分类单位。但是至今，关于种的概念还没有形成一个统一的定义，争论较大。 一般认为：微生物的种是一个基本的分类单位，是一群表型特征高度相似、亲源关系极其相近、与同属内的其他种有着明显差异的菌株的总称。 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作它的具体代表，故此典型菌株成了该种的模式种，如产黄青霉Penicillium chrysogenum NRRL-Q176。 三.种以下的分类单元 为了使用方便，在种以下人们又提出了许多分类单元，这些分类单元不是正式的分类单位，因此，也没有得到国际公认。 1.亚种(Subspecies，subsp.,ssp.) 当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性状又不足以区分为新种时，可将这些菌株细分为两个或更多的小的分类单元--亚种。 亚种是微生物分类中具有正式分类地位的最低等级。 亚种是在种的加词后写上“subsp.”，再写上具体的亚种的加词。 蜡状芽孢杆菌亚种：Bacillus cereus subsp.mycoides 2.变种(Variety,var.) 变种是亚种的同义词，因易引起混乱，故《国际细菌命名