蛋白质与酶工程酶学基本理论 一、了解酶的分类与命名 二、酶的分子结构 1、掌握酶的概念、组成及分类,辅酶、辅基的概念。 2、掌握酶的活性中心的概念,了解同工酶、抗体酶的概念。 三、酶的工作原理 1、掌握酶的高度催化效率的本质与诱导契合学说。 四、酶促反应动力学 1、掌握酶促反应中,各因素对酶促反应的影响,最适温度、最适pH的概念。 2、掌握米—曼氏方程,米氏常数Km、Vmax的意义及其双倒数作图法测定和Hanes作图法。 3、掌握可逆抑制、不可逆抑制、竞争性抑制、非竞争性抑制和反竞争性抑制的概念及动力学特点。 五、酶的调节方式 1、掌握酶活性的调节方式 2、掌握酶量调节的方式 酶的概念 目前将生物催化剂分为两类 酶 、 核酶(ribozyme) 酶的分类与命名原则(自学为主) P酶和R酶数量高达数千种 要准确地识别各种酶,避免发生混乱或误解,就必须建立一套酶的 分类(classification)和 命名(nomenclature) 的原则 国际系统分类命名法原则-- (1)根据酶的底物来命名 Ribonuclease 核糖核酸酶 Protease 蛋白酶 (2)根据所催化的反应类型来命名 Dehydrogenase 脱氢酶 Phosphotransferase 磷酸转移酶 Aminotransferase 转氨酶 (3)上述两个原则结合- 丙酮酸脱氢酶 (4)上述原则再加上酶的来源 如:牛胰核糖核酸酶 1、P酶的分类与命名 国际酶学委员会(international commission of enzyme, ICE)于1961年提出了酶的分类与命名方案,此后不断得到补充和修改 其建议:每一种酶都有其推荐名和系统命名 推荐名:由两部分组成--底物名称+催化反应类型+“酶” 如:葡萄糖氧化酶 *对于水解酶类,可省去“水解”, 如:淀粉酶,蛋白酶,乙酰胆碱酶等 *必要时再加上酶的来源或其它特性, 如:菠萝蛋白酶,木瓜蛋白酶,碱性磷酸酶等 P酶的分类原则— 1)按照其催化作用的类型,分为6大类 2)每大类中,按底物、化学键或基团的不同,分为若干亚类 3)每一亚类中分为若干小类 4)每一小类包含若干个具体的酶 国际系统分类法及酶的编号、反应通式 1、氧化还原酶(1) AH2+B=A+BH2 2、转移酶 (2) AB+C=A+BC 3、水解酶 (3) AB+H2O=AOH+BH 4、裂合酶(4) AB=A+B 5、异构酶 (5) A=B 6、连接酶或合成酶(6) A+B+ATP=AB+ADP+Pi 或 A+B+ATP=AB+AMP+PPi 六大类编号依次为 1. 2. 3. 4. 5. 6 亚类编号依次为 1. 2. 3. 4. 5. 6……. 亚-亚类编号依次为 1. 2. 3. 4. 5. 6……. (1)氧化还原酶类(Oxidoreductases): 包括脱氢酶、氧化酶、过氧化物酶、氧合酶、细胞色素氧化酶等 其催化的反应通式:AH2 + B = A + BH2 被氧化的底物(AH2)为氢或电子供体 被还原的底物(B)为氢或电子受体 系统命名:供体在前,受体在后,再加上氧化还原 酶字样,即 “醇:NAD + 氧化还原酶” 其推荐名:某供体脱氢酶(谷氨酸脱氢酶) 或某受体还原酶(硝酸还原酶) (2)转移酶类(Transferases): 包括酮醛基转移酶、酰基转移酶、糖苷基转移酶、含氮基转移酶等 催化某基团从供体化合物转移到受体化合物上的一类酶。反应通式: AB + C = A + BC 系统命名--供体:受体+某基团转移酶 如:L-天冬氨酸:2-酮戊二酸氨基转移酶 推荐名-- 受体(或供体)+某基团转移酶 上述同一酶为: L-天冬氨酸氨基转移酶 (3)水解酶类(Hydrolases): 包括蛋白酶、脂肪酶、糖苷酶、肽酶等;一般不需要辅酶,催化各种化合物进行水解反应的一类酶,其反应通式为:AB + H2O =AOH + BH 系统命名:底物+发生水解作用的化学键位置+水解酶 如:5’-核苷酸磷酸水解酶,其底物是5’-核苷酸,水解反应发生在磷酸酯键上 推荐名:底物+酶,如5’
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