生物信息学分子系统发育分析.PPT

分子系统发育分析 毛理凯 本课目录 总括 多序列比对 构建系统树 系统发生软件 一、总括 系统发生学(phylogenetics) 亦称系统学,种系发生学,种系发生系统学(phylogenetic systematics) 在希腊文中 phylon = tribe, race(种系) genesis = birth 研究生物群体(如:物种,种群)之间的进化关系 相关概念 phylogenetic taxonomy(系统发生分类学) 是系统学的一个分支 根据进化相关度对生物群体分类 phylogeny (=phylogenesis系统发生) 生物群体的产生和进化 分子系统学(molecular phylogenetics) 将核酸,氨基酸序列作为进化特征 系统发生树(phylogenetic tree) 也叫系统树,进化树(evolutionary tree),生命树(tree of life) 对物种之间的进化关系的一种描述,这些物种被认为有共同祖先 有根树和无根树 无根树和有根树的关系(1) 从一棵有根树总可以产生一棵无根树 而从无根树产生有根树需要额外的数据 无根树和有根树的关系(2) 一棵无根树可以产生多棵有根树 Willi Hennig (1913-1976) 德国生物学家,被认为是系统发生学和分类学(cladistics; 也叫cladogram)的奠基人 据已知资料