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生物配体及其配合物
在大多数情况下,金属元素并不是以自由离子形式存在于生物体内,而是与生物体中具有生物功能的配体形成各式各样的配合物,这些生命内的配位体称为生物配体。按照相对分子量的大小,生物配体可分为两大类:一类为大分子配体,包括蛋白质、多糖、核酸等,其分子量大小从几千到数百万不等;另一类为小分子配体,包括氨基酸、羧酸、卟啉等。
氨基酸
氨基酸是指含有氨基的羧酸,为蛋白质的基本组成单位。按照软硬酸碱理论,氨基酸具有碱性较强的氨基及碱性较弱的羧基,故氨基酸具有很强的配位能力,能与大多数过渡及稀土元素形成配合物。
氨基酸的结构通式
自然界中已发现氨基酸有上百种,但从蛋白质水解产物中分解出来的氨基酸通常只有20种,而且这些氨基酸,除脯氨酸外,具有相似的结构单元,均为α-氨基酸,即羧酸分子中α-碳原子的一个氢原子被氨基取代而成的化合物。其结构通式可用下式表示。式中R 为α-氨基酸的侧链,方框内的基团为各种氨基酸的共同的结构。
不带电形式 带电形式
图1-1 氨基酸结构通式
氨基酸的分类
氨基酸分类法有多种,这里根据组成蛋白质的20种氨基酸的侧链R基的化学结构的不同,分为4大类:
脂肪族氨基酸:① 一氨基一羧基氨基酸:甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸;②一氨基二羧基氨基酸及其酰胺:谷氨酸、谷氨酰胺 、天冬氨酸、天冬酰胺;③二氨基一羧基氨基酸:赖氨酸、精氨酸;
芳香族氨基酸:苯丙氨酸、酪氨酸;
杂环氨基酸:组氨酸、色氨酸;
杂环亚氨酸:脯氨酸。
表1-1 氨基酸分类表
普通名称
中英文简称
结构式
等电点
1、脂肪族氨基酸
一
氨
基
一
羧
基
氨
基
酸
甘氨酸
甘
Gly
5.97
丙氨酸
丙
Ala
6.00
缬氨酸
缬
Val
5.96
亮氨酸
亮
Leu
5.98
异亮氨酸
异亮
Lle
6.02
蛋氨酸
(甲硫氨酸)
蛋
Met
5.74
半胱氨酸
半胱
Cys
5.07
丝氨酸
丝
Ser
5.68
苏氨酸
苏
Thr
6.16
一氨
基二羧基
氨基
酸
谷氨酸
谷
Glu
3.22
天冬氨酸
天
Asp
2.77
二
氨
基
一
羧
基
氨
基
酸
赖氨酸
赖
Lys
9.74
精氨酸
精
Ary
10.76
2、芳香族氨基酸
苯丙氨酸
苯
Phe
5.48
酪氨酸
酪
Tyr
5.66
3、杂环氨基酸及杂环亚氨基酸
组氨酸
组
His
7.59
色氨酸
色
Try
5.89
脯氨酸
脯
Pro
6.30
氨基酸的立体异构和旋光性
从上述结构通式可看出,除R为H(甘氨酸)外,所有α-氨基酸分子中α-碳原子都为不对称碳原子。因此,第一,氨基酸都具有旋光性,能使偏振光平面向左或右旋转,左旋者通常用(—)表示,右旋者用(+)表示;第二,每一种氨基酸都D-型和L-型两种立体异构体。蛋白质水解产物中的α-氨基酸都属于L-型,即与L-甘油醛同型。生物体中,特别是在细菌中也有D-型氨基酸。D-型氨基酸和L-型氨基酸结构式如图1-2所示。
D-型氨基酸 L-型氨基酸
图1-2 D-型和L-型氨基酸
氨基酸的酸碱性质
实验证明,氨基酸在水溶液中或晶体状态时都以离子形式存在,与无机盐不同的是它以两性离子的形式存在,即 ,所谓两性离子是指在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的 正离子和能接受质子的负离子。因此氨基酸是两性电解质。
氨基酸的两性离子在水溶液中有如下平衡:
正离子 两性离子 负离子
上述三种离子的浓度,随溶液pH而变。如果适当调节水溶液pH,使氨基酸的酸性电离和碱性电离恰好相抵消,氨基酸在溶液中只以两性离子的形式存在,分子的净电荷为零,这时的pH称为氨基酸的等电点(pI)。在等电点的氨基酸分子很容易聚集并沉淀析出,利用各种氨基酸的等电点不同,可使它们彼此分离。
蛋白质
蛋白质是动物、植物和微生物细胞中最重要的有机物质之一。除含有碳、氢、氧、氮外,含有少量的硫。不同蛋白质的含氮均有一定的比例,这是蛋白质的一重要特点。一般蛋白质含氮在15%~17.6%,平均值为16%,因此只要测定样品的含氮量就可以计算求出样品蛋白质含量。实验已经证明蛋白质是由各种氨基酸通过肽键连接而成的多肽链,再由一条或多条肽链按各自特殊方式组合成完整生物活性的大分
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