科学现代生物学的发展.ppt

第七章 生物信息学的发展和展望 生物信息学的发展 生物信息学前沿 展望 生物信息学的发展 生物信息学的发展历程 生物信息学的发展现状 生物信息学的发展方向 生物信息学的发展历程 生物信息学自诞生以来，经历了三个阶段： 基因组前期的生物信息学：主要是序列分析、数据库的查询、计算机操作和PC的应用 基因组年代的生物信息学：主要是基因的寻找、数据与数据之间的比较、网络相互界面（Interface） 后基因组年代的生物信息学：主要是数据的挖掘、表达、数据多样性的分析、相互交叉数据分布的总结与分析。其研究的内容不仅包括基因的查寻和同源性分析；而且进一步到基因和基因组的功能分析，即所谓的功能基因组学研究 发展现状 生物信息学的发展将会对生命科学带来革命性的变革。它的成果不仅对相关基础学科起巨大的推动作用，而且还将对医药、卫生、食品、农业等产业产生巨大的影响，甚至引发新的产业革命 国外发展现状 各国政府和工业界对生物信息学极为重视，投入了大量资金。欧美各国及日本相继成立了生物信息中心，如美国的国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Informatics，NCBI）、欧洲生物信息学研究所 (European Bioinformatic Institute，EBI)、日本信息生物学中心（Center for Information Biology，CIB）等。NCBI、EBI和CIB相互合作，共同维护着GenBank、EMBL、DDBJ三大基因序列数据库。它们每天通过计算机网络互相交换数据，使得三个数据库能同时获得最新数据。此外，他们每年召开两个年会讨论合作事宜 国内发展现状 在我国，生物信息学随着人类基因组研究的展开才刚刚起步，但已显露出蓬勃发展的势头。在政府的支持和科学家的呼吁下，国家级生物医学信息学中心正在筹建之中 各地政府也给予了足够重视，北京市已经成立了北京生物工程学会生物信息学专业委员会（即北方生物信息学研究会），目的在于联合北方地区从事生物信息学的专家，加强合作，促进学科的发展，并为政府决策提供参考意见 国内的一些科研单位 国内一些科研单位已经开始摸索着从事这方面的工作。清华大学在基因调控及基因功能分析、蛋白质二级结构预测方面、天津大学物理系和中科院理论物理所在相关算法方面、中科院生物物理所在基因组大规模测序数据的组装和标识方面、北京大学化学学院物理化学研究所在蛋白质分子设计方面、华大基因组研究中心（中科院遗传所人类基因组研究中心）在大规模测序数据处理自动化流程体系及数据库系统建立方面均已展开相关研究。复旦大学遗传学研究所为克隆新基因而建立的一整套生物信息系统也已初具规模；中科院上海生化所、生物物理所等单位在结构生物学和基因预测研究方面也有相当的基础 生物信息学的发展方向 进入后基因组-蛋白组时代 人类基因组计划的研究已由结构基因组进入到功能基因组阶段。我们都知道，生命活动的执行者是基因的表达产物-蛋白质，而研究基因组的根本目的在于揭示整个生命活动的规律。因此，随着大量基因的破译及鉴定，这些基因编码的蛋白质正成为下一步研究的热点 生物信息学的发展方向 功能基因组学方面 比较基因组学 基因组医学 蛋白组学方面 血浆蛋白组计划 肝脏蛋白组计划 蛋白组标准化数据库 比较基因组学 研究不同模式基因组（model organism）与人类基因组的关系，以更好认识人类生理、病理过程和行为方式等。其中还包括对不同基因组的比较研究，认识基因或蛋白的进化规律，以便了解蛋白家族的形成和相关功能研究 病原体基因组的分析 通过对常见病原体基因组的分析，有利于了解病原体与宿主的关系、病原体的毒力、宿主对病原体感染的抵抗力和易感性等。同时通过对病原体基因组的变异分析，找出其流行规律 典型实例: 2003年春季在我国的广州、北京、香港以及新加坡、加拿大多伦多等地流行的SARS病毒 小鼠在遗传学、基因组学和蛋白组学研究的应用，及应用到人的过程也离不开比较基因组学的研究 基因组医学 预测医学的发展趋势 应用基因组学的发展 疾病的基因诊断与产前诊断 药物体体反应评价 DNA身份鉴定与亲自鉴定 植入前遗传学诊断与胎儿选择 基因治疗 基因制药与基因疫苗 转基因动物 预测医学的发展趋势 应用基因组学的发展 疾病的基因诊断与产前诊断 HGP草图完成以后,估计人有大约3万多个基因,目