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实用文档 PAGE 文案大全 蛋白质修饰位点分析 目录 TOC \o 1-4 \h \z \u 实验目的 2 实验平台 3 实验过程 4 一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰 4 1、“人类connexin43”蛋白质序列下载 4 2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点 5 3、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点 6 （1）DISPHOS 1.3预测未知蛋白磷酸化位点 6 （2）PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点 11 4、“人类connexin43”蛋白质磷酸修饰结论 14 二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰 15 1、N型糖基化位点预测 15 2、O型糖基化位点预测 18 （1）哺乳动物O型糖基化位点预测 18 （2）真核生物O型糖基化位点预测 20 3、uniprot数据库查看蛋白质糖基化修饰位点 22 4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论 22 实验结论 23 （特别提示:ctrl+单击目录下的标题链接，可以跟踪标题；ctrl+单击标题后的图标HYPERLINK \l 返回目录可以返回目录） 实验目的 找出“人类connexin43”蛋白质上面的所有可能磷酸化位点，并说明为什么（注释） 找出“人类血红蛋白”上面的糖基化位点，注释结果 实验平台 uniprot数据库: /(查看蛋白的修饰情况) 预测未知蛋白磷酸化位点 DISPHOS: /disphos/ PhosphoSitePlus: 预测未知蛋白的糖基化修饰位点 N型糖基化位点预测：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/ O型糖基化位点预测：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/ http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/ 实验过程 一、“人类connexin43”蛋白质磷酸化位点修饰 1、“人类connexin43”蛋白质序列下载 蛋白序列： fasta.txt 2、uniprot数据库查看蛋白磷酸化位点 网站链接： / 3、在线软件预测指定蛋白磷酸化位点 （1）DISPHOS 1.3预测未知蛋白磷酸化位点 网站链接： /disphos/ 开始预测 结果 DISPHOS由蛋白序列预测蛋白磷酸修饰位点，总共有37个丝氨酸修饰位点，13个苏氨酸修饰位点，16个酪氨酸修饰位点。但是根据打分，只有8个丝氨酸修饰位点可能存在。 （2）PhosphoSitePlus预测指定蛋白磷酸化位点 网站链接： 开始预测 结果 筛选参考文献来源多于5篇的磷酸化修饰位点，丙氨酸磷酸化修饰位点数目为1、丝氨酸为17、苏氨酸数目为1、酪氨酸数目为7。 4、“人类connexin43”蛋白质磷酸修饰结论 在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致，“人类connexin43”蛋白质磷酸位点数量相对一般蛋白质较多，且丝氨酸磷酸修饰位点最多。“人类connexin43”蛋白质极有可能是一种活性较高的蛋白质，与机体的生物活性显著相关。 通过各种文献阅读和网络筛选发现connexin43蛋白质是一种哺乳动物连接蛋白，是主要的细胞缝隙连接蛋白，其表达的异常与多种疾病的发生有关。 二、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰 Ncbi下载人类血红蛋白的蛋白序列保存为： hemoglobin.txt 1、N型糖基化位点预测 网站链接：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/ 开始预测 结果 2、O型糖基化位点预测 （1）哺乳动物O型糖基化位点预测 网站链接：http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/ 开始预测 结果 （2）真核生物O型糖基化位点预测 网站链接：http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/ 开始预测 结果 3、uniprot数据库查看蛋白质糖基化修饰位点 4、“人类血红蛋白”糖基化位点修饰结论 在线数据库查询和在线软件预测结果基本一致，人类血红蛋白基本没有O型糖基化修饰位点,但是存在N型糖基化修饰位点。血红蛋白是高等生物体内负责运载氧的一种蛋白质，糖基化修饰可能和血红蛋白的信号传导功能有关。 实验结论 人类connexin43”蛋白质磷酸位点数量相对一般蛋白质较多，且丝氨酸磷酸修饰位点最多；人类血红蛋白基本没有O型糖基化修饰位点,但是存在N型糖基化修饰位点。