同源建模工具easymodeller40-操作说明.ppt

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2019-07-20 发布于四川
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EasyModeller 4.0 使用说明 ----By Xm 中科院昆明动物研究所 2014.3.11 Before using 需要安装的软件： Python(2.5,2.6,2.7系列均可，3系列不可) Modeller（） Easymodeller 4.0 RasMol (windows版 ) Office Excel *以上软件都能在官网或网站上下载，软件需要安装在C盘默认路径下，easymodeller 需安装在modeller目录下，所有安装路径中都不要出现中文！！同源建模的基本步骤 1、模板蛋白搜索： PDB数据库、BLAST(或PSI-BLAST) 、获取模板（一个或多个） 2、比对结果的校正 3、主链生成 4、环区建模 5、模型优化 6、合理性检测模板.pdb文件准备选择align结果中的蛋白，就可以找到相应的蛋白3D结构，下载pdb文件即可 Start using 点在蓝色区域内大于90%时该模型才算好模型