加利福尼亚兔和新西兰兔UCP1基因第5外显子多态性-江苏农业科学.PDF

江苏农业科学　２０１６年第４４卷第１期 — ４１— 李　维，林家栋，刘若余，等．加利福尼亚兔和新西兰兔ＵＣＰ１基因第５外显子多态性和生物信息学研究［Ｊ］．江苏农业科学，２０１６，４４（１）：４１－４４． ｄｏｉ：１０．１５８８９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００２－１３０２．２０１６．０１．０１０ 加利福尼亚兔和新西兰兔 ＵＣＰ１基因第５外显子 多态性和生物信息学研究 １ １ １ １ １ ２ １ 李　维 ，林家栋 ，刘若余 ，谢海强 ，李　思 ，杜雪琴 ，肖超能 （１．贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室／贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室／ 贵州大学动物科学学院，贵州贵阳５５００２５；２．贵阳市小河第三实验学校，贵州贵阳５５０００６） 　　摘要：本试验以加利福尼亚兔和新西兰兔为研究对象，分别用磁珠法动物基因组ＤＮＡ抽提试剂盒提取新西兰兔 和加利福尼亚兔的ＤＮＡ，通过构建ＤＮＡ池，扩增 ＵＣＰ１基因的第５外显子及第４内含子部分序列。扩增产物进行双 向测序，利用ＤＮＡＳｔａｒ和ＢＬＡＳＴ分析测序结果。结果发现：在加利福尼亚兔中没有发现ＳＮＰ位点，在新西兰兔中有４ 个多态性位点，分别为Ｇ７４３Ｔ、Ａ７４４Ｇ、Ｃ８１９Ａ和Ｇ８４９Ｔ，其中Ｇ７４３Ｔ为同义突变，Ａ７４４Ｇ为错义突变，导致编码的苏氨 酸（Ｔｈｒ）变为丙氨酸（Ａｌａ）；Ｃ８１９Ａ、Ｇ８４９Ｔ突变位点位于内含子区。多态位点的出现对 ＵＣＰ１基因的ＲＮＡ二级结构产 生的影响表现在其最小自由能由－１．９３ＭＪ／ｍｏｌ变为－１．９３２ＭＪ／ｍｏｌ，同时ＳＮＰｓ位点对 ＵＣＰ１基因蛋白结构也有一 定影响。 　　关键词：ＵＣＰ１基因；新西兰兔；加利福尼亚兔；ＳＮＰｓ；ＲＮＡ二级结构 　　中图分类号：Ｓ８２９．１２　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１６）０１－００４１－０３ 　　解偶联蛋白 （ｕｎｃｏｕｐｌｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ，ＵＣＰｓ）是褐色脂肪细胞 三酰甘油的贮存，使脂肪分解，非脂化脂肪酸增加，促进产热 线粒体内膜上存在的一种质子转运蛋白，它存在于动物的各 ＵＣＰ１表达增加还有可能受肾上腺素和甲状腺 作用。此外， 组织中，在能量平衡、维持体温、机体产热和代谢等方面都起 素等的剌激，从而增加棕色脂肪组织所消耗脂肪酸的活性，因 ［１－６］ ［１５－１７］ 着巨大的作用 。比如，它激活后可以产生质子电化学梯 此 ＵＣＰ１被认为是２型糖尿病和抵抗肥胖的重要基因 。 度降低，使呼吸链与ＡＴＰ（三磷酸腺苷）合成过程解耦联，使 Ｃｌａｒｋ等发现，ＵＣＰ１基因的表达水平对羔羊出生后的成 ［１８］ 能量以热的形式释放；ＵＣＰ１基因参与机体能量代谢，对机体 活率起着重大作用 。Ｂａｓｓｅｔｔ等发现，ＵＣＰ１基因的表达对 ［１９］ 能量平衡涉及的食物转化效率、静止代谢率和体重肥胖等性 初生羔羊 ＢＡＴ的含量影响重大 。然而对兔线粒体中 状具有明显的效应，对肌肉生长和品质的改 良作用重 ＵＣＰ１基因方面的研究很少，本试验以加利福尼亚兔和新西 大［７－１０］。目前，这个家族的５种蛋白质在鱼、禽类、哺乳动物 兰兔构建其ＤＮＡ池，对 ＵＣＰ１基因第５外显子及第４内含子 甚至在人类的不同组织线粒体的内膜上都已发现［１１－１４］。其 部分序列进行扩增，ＢＬＡＳＴ分析其测序结果筛选多态位点，