生物医学文本挖掘研究的体会讲义.ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 闭合式知识发现过程是从A和C出发，寻找共同的中间词B。其目的是验证开放式研究发现的一些关系是否有实际的生物学意义。Swanson开发的网络应用软件ARROWSMITH即体现了闭合式挖掘这一思想。在成功预言了镁缺乏与神经系统疾病（1988年）的关系之后，Swanson又利用ARROWSMITH系统成功地预言了消炎痛与阿尔茨海默氏症（1996年）、雌激素与阿尔茨海默氏症（1996年）、游离钙磷脂酶A2与精神分裂症（1998年）之间的关系，并发现了可以作为生物武器的潜在病毒（2001年）。 * * * * 2001年,Swanson 等利用ARROWSMITH发现了还有很多病毒可作为潜在的生物学武器 * * 开放式知识发现的过程是，对某个初始研究主题A，在MEDLINE的标题字段检索其相关文献，寻找与A在标题中共同出现的中间词B，通过筛选得到有一定意义的B，进而重复上述过程，得到目标词C。 开放式挖掘初衷是从某个疾病或药物初始，寻找疾病的潜在病因和治疗方法或者药物的潜在治疗应用。 * * 闭合式的知识发现 ARROWSMITH 3.0 可作为生物武器的潜在病毒 能够成为生物武器：致病性，传播性。同时涉及到病毒这两个特性