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肠道菌群的开发利用与3株具有开发价值的菌株简述 By夏远川 人体胃肠道是宿主、环境因子和抗原在人体中最大的界面之一。随着食物的摄入，大量来自环境的微生物，包括细菌、古菌和真核微生物在消化道中形成复杂而动态的微生物种群，即肠道微生物群。肠道细菌对宿主的机体稳态和疾病发生过程有显著影响，在维持机体免疫和代谢稳态、抵御病原菌等方面发挥着重要作用。这种作用在人的一生中是如此重要而不可忽视，因此我们用“超有机体”来描述宿主和居住在其中的微生物所组成的统一整体。 健康的肠道菌群可以通过增强肠壁完整性、塑造肠上皮、收集能量、防御病原菌、调节宿主免疫等方式为宿主带来生理健康方面的好处。而肠道菌群组成失调则与许多炎症疾病和感染的发病机制有关。 肠道菌群的多样性不像其他身体部位的微生物群落那样丰富且显示出高度的功能冗余。肠道菌群的组成由环境因素主要是饮食决定，也可能和宿主基因有关，但在组成上不同的肠道微生物仍然可能具有某种程度的功能冗余即它们产生相似的蛋白质或代谢产物谱，这一信息对于制定治疗策略来改变和重塑个体的异常肠道菌群至关重要。 无论微生物群的失调是疾病的起因还是后果，都可能加剧疾病的恶化程度，并影响恢复良好共生关系所需的对策。这些对策的制定需要根据疾病的类型和阶段，包括以改变肠道菌群为目的，进行肠道菌群调节物的研发(如抗菌素、饮食、益生元、益生菌)；或使用以微生物为基础的方案对有缺陷的微生物进行替换从而完善肠道菌群的功能(如使用特定的共生菌、益生菌、特定的微生物群落、微生物来源的信号分子或代谢物)。考虑到宿主基因特征在许多与菌群失调相关的疾病中的作用，可能还需要双重治疗策略(例如结合免疫治疗和菌群靶向方法)来恢复宿主和靶向菌群之间重新建立有效沟通所需的环境。[1] 以下例举3株具有开发价值的菌株： 一：植物乳杆菌（Lactobacillus plantarum）[2] 2016年发表于Science的一篇研究报道显示研究者已发现Lactobacillus plantarum 菌株Lp WJL缓解了慢性营养不良对无菌小鼠出生后生长的不利影响。 该研究首先通过向无菌小鼠移植人的肠道菌群的方式来建立肠道菌群异常导致的幼年期营养不良的小鼠模型，模型小鼠和野生型对照小鼠采用相同的标准育种饲料进行伺喂，断奶后两组小鼠均摄取相当于体重的食物量，伺喂至成年期（8周）进行生长状况评估，证明肠道菌群会影响幼年小鼠的生长发育情况。 8周龄时，模型小鼠比野生型小鼠重14.5%并且比野生型小鼠短4%，肠道菌群确保了小鼠具有最佳的体重增加和纵向生长；野生型小鼠的器官增重要大于模型小鼠的器官增重，野生型小鼠的肠道菌群与幼鼠能否以最佳发育模式生长有关；野生型小鼠长4%，表明肠道菌群也影响骨骼生长（骨生长参数，包括股骨长度、皮质厚度、皮质骨分数和股骨的小梁部分；皮质骨矿物质密度未受影响）。 对慢性营养不良的影响，以及肠道菌群对出生后生长发育的影响的研究则通过对断奶后的模型小鼠和野生型小鼠伺喂低营养价值的饲料（仅含有8.6%的蛋白质和2.4%的脂肪，并且缺乏维生素）并检测它们的生长直至8周龄来进行。 适应固体食物的一周中两组小鼠体重都有下降，其中模型小鼠体重下降幅度更大，适应固体食物后，模型小鼠的生长仍然受阻，野生型小鼠则恢复生长，尽管体重和纵向生长程度低于标准饲料伺喂的对照小鼠但确实得到了恢复。这一实验表明模型小鼠发育不良，不是食物摄入量相对于体重变化的结果，也并非由于对食物中能量的摄入能力发生了变化，而是因为野生型小鼠拥有的健康肠道菌群有助于在慢性营养不良期间维持幼鼠的生长发育。 对小鼠发育过程中生长激素轴的检测分析显示肠道菌群通过维持全身性的生长激素轴活动来维持幼鼠在营养不良期间的生长发育。 然后研究者使用通过果蝇单结构化模型筛选出的两株植物乳杆菌菌株Lp WJL和Lp NIZO2877处理单克隆的模型小鼠并使它们交配从而得到由成体自然获得两种植物乳杆菌的小鼠，小鼠断奶后伺喂低营养饲料并观察生长情况。最终发现两株菌株都对幼鼠发育具有积极影响，并且Lp WJL的助益更多，这是因为Lp WJL维持生长轴活动的能力更强，很大程度上复制了野生型小鼠的生长特征，而Lp NIZO2877处理的动物的生长特征则更类似模型小鼠；并且这种助益不仅能在低营养饲料伺喂的小鼠中体现，喂养标准饲料的幼鼠中也能观察到。 这项研究对儿童营养不良的解决方案提供了改善营养以外的思路。儿童营养不良并不总是能通过改善营养来纠正，肠道菌群在儿童营养不良中具有病理性的影响，而Lp WJL可以改善这种情况，即具有治疗营养不良综合征的潜力。 二：Akkermansia Muciniphila Akkermansia Muciniphila主要存在于结肠的黏液层中，对肠道屏障功能的维持起到重要作用；但同时其相关序列