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第三章 质粒载体 第一节 质粒载体概况 第二节 质粒DNA的复制与拷贝数的控制 第三节 质粒载体的构建 第四节 重要的质粒载体 第五节 质粒载体的稳定性问题 第一节 质粒载体的概况 质粒的定义、命名、分类、分布 质粒的基本生物学特性 质粒的分离与纯化 一、质粒的定义、命名、分类、分布 定义:质粒是一类寄宿于细胞内,独立于染色体外的自我复制并稳定遗传的环状双链DNA分子。 命名:小写字母p代表质粒,两个大写字母代表发明者,后接实验编号, 分类: 分布: 质粒分类 1、根据质粒的性状特征分为: 1)F质粒:又叫F因子或性质粒(sexplasmid)。 2)R质粒:通称抗药性因子。编码有一种或数种抗菌 素抗性基因。 3)Co1质粒 :产生大肠杆菌素因子。编码有控制大肠 杆菌素合成的基因。 2、根据质粒的传递性 3、根据质粒的拷贝数 4、根据质粒和细菌的关系 5、质粒分布、大小和数目 二、质粒的基本特性 寄生性 质粒DNA构型 质粒DNA编码的表型 质粒DNA的复制类型 质粒的不亲和性 其他特性 大肠杆菌质粒分子的结构示意图 2、质粒DNA分子的三种构型 SC构型: 是指两条多核苷酸链均保持着完整的环形 结构时,称为共价闭合环形DNA(cccDNA),即超螺 旋的 SC构型。 OC构型: 两条多核苷酸链中只有一天保持完整的环 形结构,另一条出现一至数个缺口时,称开环DNA (ocDNA),即OC构型; L构型: 质粒DNA经酶切,发生双链断裂而形成线 性分子(LDNA),L构型。(见图) 不同质粒DNA分子量差异显著,最小的仅能编码2-3种蛋白质,分子量约为106 ,最大的可达108。 基因克隆载体的质粒DNA分子,必定包括三种共同的组成部分,即复制基因、选择性记号和克隆位点。 3、质粒DNA编码的表型 质粒DNA仅占细胞染色体的1-3%,但却编码着一些重要的非染色体控制的遗传性状,包括抗性特征、代谢特征、修饰寄主生活方式的因子及其它方面的特征,其中对抗菌素的抗性时质粒的最重要的编码特性之一。 4、质粒DAN的复制类型 严紧型质粒:每个寄主细胞仅含有1-3份的拷贝,称“严紧型”复制控制的质粒。 松驰型质粒:每个寄主细胞中可高达10-60份的拷贝,称“松弛型”复制控制的质粒。 质粒拷贝数:每个细菌染色体平均具有的质粒DNA 分子的数目。 质粒究竟是属于严紧型还是松弛型并非绝对,它不仅受自身的制约,还受寄主的控制。 质粒DNA拷贝数的控制 高拷贝质粒DNA复制的启动,是由质粒编码基因合成的功能蛋白质调节的,与寄主细胞周期开始时合成的不稳定的复制起始蛋白质无关。 低拷贝质粒的复制是受寄主细胞不稳定的蛋白质控制的,并与寄主细胞染色体同步进行。 用蛋白质合成抑止剂氯霉素或壮观霉素处理寄主细胞,使染色体DNA复制受阻的情况下,松弛的质粒仍可继续扩增。而严紧型质粒则不行。 5、质粒的不亲和性 质粒的不亲和性又称不相容性,是指在没有选择压力的情况下,两种亲缘关系密切的不同质粒,不能在同一寄主细胞系中稳定共存的现象。 质粒彼此之间是互不相容的,这样的质粒属于同一个不亲和群,如pMB1的派生质粒(或ColE1派生质粒)。彼此能够共存的亲和的质粒则是属于不同的不亲和群。属于同一不亲和群的质粒的亲缘关系上比较接近。 6、质粒的其他特性 稳定性:维持一定的拷贝数 同源性:不同的质粒有相同的同源区 重组性:质粒间、质粒同染色体间重组 消除和恢复性等特性 第二节 质粒DNA的分离与纯化 氯化铯密度梯度离心法 碱变性法 微量碱变性法 影响质粒DNA产量的因素 (1)寄主菌株的遗传背景 (2)质粒的拷贝数及分子大小 质粒作为基因克隆的载体分子,一个重要的条件是获得批量的纯化的质粒DNA分子。因而寄主细胞的裂解作用是分离质粒DNA的关键步骤。 通常的裂解是加入溶菌酶或SDS使大肠杆菌细胞裂解。 理想的状况是,使每个细胞都充分破裂到能使质粒DNA顺利溢出,而又没有污染过多的染色体DNA。 1、氯化铯密度梯度离心法 优点:可获得高纯度、高质量的质粒DNA。 缺点:操作复杂; 价格昂贵(氯化铯); 设备要求高(超速离心机); 易造成环境污染和人员伤害(溴化乙锭是一 种极强的诱变剂) 原理:是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA片断之间,在拓扑学上的差异发展出来的。 加热或PH介于12.0-12.5的范围内,线性DNA会被变性
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