遗传多样性的分子理论.pptx

遗传多样性的分子理论;本章的主要内容;§1 遗传变异的分子基础;变异的类型;DNA序列的多态性;无限等位基因模型;一个长度为500bp的座位上5个等位基因的DNA序列比对;同义突变和非同义突变;DNA序列多态性的度量 ;DNA序列多态性的度量 ;§2 基因融合和基因树;负二项分布;几何分布;几何分布的性质;几何分布的期望和方差;基因在祖先世代中的融合;基因融合模型;理想群体中6个等位基因的谱系图;基因融合模型的优点;两个基因融合发生的时间T2 ;两个基因融合时间T2的期望和方差;k个基因的融合;k个基因融合时间Tk的期望和方差;k个基因发生k-1次融合的时间T1 ;k个基因完全融合的时间T1 ;当前群体中6个基因的融合过程;基因树及其特性;基因树及其特性;基因树中所有分支的总长度;基因融合模型的作用;§3 中性突变理论;中性突变;中性理论;中性突变与有限随机交配群体;中性突变与遗传漂变中的近交系数;中性突变与遗传漂变的平衡近交系数;平衡群体的杂合度;参数θ=4Nu的估计;例子;突变和漂移对群体结构的共同影响;突变和漂移达到平衡状态的特点;突变和漂移达到平衡状态的特点;平衡状态下的等位基因个数;平衡状态下的等位基因构成;等位基因个数的估计;特殊条件下的等位基因个数;不同大小样本群体中的平均等位基因个数;样本群体中观测等位基因构成的概率;例子：N=5，n=10 ;利用等位基因构成检验中性理论;参数θ的两种估计方法;参数θ的两种估计方法;中性突变理论的Tajima D检验;Tajima D检验统计量;例子（表1中的5条DNA序列）;迁移和漂变的联合作用;迁移和漂变的联合作用;迁移与突变之间的相似性;平衡群体的近交系数随迁入个体数的变化曲线;可逆突变和漂变的联合作用;可逆突变、迁移和漂变的联合作用;§4 近交系数计算方法小结 ;不同交配系统的近交系数;一种或多种遗传因素作用下，理想群体的近交系数，不考虑选择的作用;近交系数在群体遗传中的作用;近交系数的相对性;度量近交系数的基础群体;自然无性系群体;自然自交群体;自然异交群体;自然混合自交和异交群体;人工控制杂交产生基础群体;自交系及其互交产生的群体;自交系之间互交产生的基础群体;杂种F2群体的近交系数;回交群??的近交系数;四交群体的近交系数