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Chapter 3DNA replication;;问题:
1、双螺旋如何打开?
2、打开所需的能量从何而来?;5’;2、半保留模型的证实:Meselson-Stahl实验(1958年);;3、半保留复制机制
复制时DNA双螺旋的两条链解开,并分别作为模板指导互补链的合成。每个子代DNA的一条链来自亲代的DNA,另一条链则是新合成的 。;问题:
1、复制可以随机起始吗?
2、复制是单向的还是双向的?
;二、复制的起点、终点和方向;复制起点(origin);问题:
1、新生链合成的方向是从5’to 3 ’
还是3 ’to 5’,还是两个方向均可?
2、复制时两条链是完全解开吗?
3、两条链是同时进行复制的吗?;三、半不连续复制模型
1968年 Okazaki(冈畸)
;;3′;四、RNA引物(RNA primer) ;问题:为什么需要有RNA引物来引发DNA复制呢?
(1)RNA引物可以提供3’-OH末端作合成新DNA链起点;
(2)提高了DNA复制的准确性。因为DNA复制开始时掺入的核苷酸往往容易出错,加在RNA引物中可以被切除,不会影响DNA复制的准确性。 ;五、参与DNA复制的蛋白质;3. 引发酶(primase)
Dna G (E. coli )
引发体 Primosome
4. DNA连接酶(DNA ligase)
需要能量
NAD(E. coli )/ ATP(真核)
5. DNA螺旋酶(DNA gyrase)---- 拓扑异构酶Ⅱ
断裂双链
引入负超螺旋 (swivel function)
需要ATP;6. DNA聚合酶(DNA polymerase, Pol)
Three DNA Polymerases (E. coli);讨论:
1、Pol I and III功能上有哪些相同点?
2、 Pol I and Pol III功能上有哪些不同?
;(4)Pol I and Pol III相同的功能特点:
[1] 以脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)为底物催化合成DNA
[2] 需要模板(3′ 5′)和引物的存在
[3] 不能从头合成新的DNA链(必须有3 ’ -OH末端)
[4] 催化dNTP加到生长中的DNA链的3’-OH末端
[5] 催化DNA合成的方向是5 ’ →3’
[6] 有 3 ′ 5 ′核酸外切酶活性(校对功能);(5)Pol I and Pol III不同的功能特点:
[1] 5 ’ →3’核酸外切酶活性不同。
[2] Pol I 可进行缺刻平移、去除引物。
[3] 二者聚合酶活性不同,Pol III是大肠杆菌
DNA复制中链延长反应的主导聚合酶。
[4] Pol I 主要功能是进行DNA 损伤修复。
;Composition of E. coli DNA Polymerase III Holoenzyme;;2、DNA聚合酶III----形成不对称的二聚体
使前导链、滞后链的合成可同时进行;后滞链模板形成了一个回环,使环中RNA引物和冈崎片段的合成方向与前导链一致,以适应双链在同一复制体上进行复制;“θ”型复制
环状DNA的复制方式,即从复制起点开始,双向同时进行,形成θ样中间物
环节:
DNA复制的起始
DNA链的延伸
DNA复制的终止 ;一、细菌DNA复制起始
(一)复制起始复合体
DnaA(起始点结合蛋白)
DnaB(解旋酶)
SSB
DnaC(装载解旋酶和引发酶)
HU(识别并刺激OriC 形成开链)
Gyrase(促旋酶)---拓扑异构酶Ⅱ;(二)复制起始区的结构特点
1、富含AT
2、3个13bp的重复序列---解链的位点
3、4个9bp的重复序列----- DnaA结合位点;(三)复制起始引发的过程:
1、DNA复制起点双链解开 ,形成复制叉;;2、RNA引物的合成
leading strand: primase(引发酶)
lagging stran
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