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斑点印迹杂交; 掌握斑点印迹杂交的原理及方法
;杂交:具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下(适宜的温度及离子强度等)可按碱基互补原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。杂交的双方是待测核酸及探针。
斑点杂交:是指将待测的DNA变形后点加在硝酸纤维素膜(或尼龙膜)上,用已标记的探针进行杂交,洗膜(除去未结合的探针),放射自显影,判断是否有杂交或其杂交强度,主要用于基因缺失或拷贝数改变的检测。根据点样磨具不同,点样形状呈圆形称为斑点杂交,呈狭缝形则称为狭缝杂交。; 斑点印迹杂交不需要电泳和转移,杂交过程包括点样,变性,中和,干燥固定,预杂交,杂交,封闭,检测杂交结果等步骤,相对southern印迹杂交和Northern印记杂交来说快,适合于同时分析多个样品。
;实验步骤:
变性:按8:1将80ul ddH2O加入至10ul待测DNA样品中,稀??样品。100℃加热10min后,立即置于冰中5min(使DNA变性),加入90ul 20×SSC混匀。
点样:将上述变性后的样品180ul点在尼龙膜的毛面上,真空抽滤,室温下风干后,于烤箱中120℃烘烤15min。使变性的DNA与膜结合牢固
预杂交:将膜封入15ml离心管中,做好剪角标记。加入预杂交液3ml。置42℃恒温摇床上,轻轻振摇30min。封闭杂交膜上多余的非特异性DNA结合位点
杂交:加入探针3ml(生物素-DNA),置42 ℃恒温床上,轻轻振荡1-2h。变性DNA与探针结合;5 洗膜:倒掉杂交液,洗液1(每次5ml)洗膜三次(洗液1预热到42℃),每次5min;再将洗液2 (每次5ml)洗膜两次(预热到42℃),每次15min。洗去未结合的探针,否则本底会太高
6 封闭:倒掉洗液2,加入5ml封闭液,37℃作用15min。封闭杂交膜上非特异性的蛋白结合位点
7 酶联抗体结合:倒掉封闭液,加入3ml亲和素-辣根过氧化物酶(HRP),于37℃轻轻振摇30min。酶联抗体与生物素结合
8 洗膜:倒掉第七步骤中液体,加入5ml洗液3,洗膜三次,每次2-3min。洗去未结合的酶联抗体
9 显色:洗膜后,加3ml的显色液避光显色1-2min,斑点出来后就可倒掉显色液,用ddH20冲洗几次,终止显色。
;斑点杂交预期结果图;
制备样品→点样→固定(可用斑点杂交仪或直接点样)
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