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暨南大学博士学位论文 题名 （中英对照）：大型海藻龙须菜栽培生态系统微生物群落结构及 功能研究 The structure and function of microbial communities in a seaweed cultivation ecosystem of Gracilaria lemaneiformis 作者姓名： 解欣斐 指导教师姓名 杨宇峰 及学位、职称： 博士 教授 学科、专业名称： 生态学 学位类型： 学术学位 论文提交日期： 2017 年11 月 论文答辩日期： 2017 年12 月 答辩委员会主席： 贺志理 教授 论文评阅人： 学位授予单位和日期：暨南大学 I 摘 要 海洋微生物多样性高，分布广泛，既是初级生产者又是分解者，与浮游植物、 浮游动物共同组成“微食物环”，在海洋生态系统物质运输与能量传递中起到承 上启下作用，是参与海洋生物地球化学循环不可或缺的一环。因此，了解海洋微 生物的多样性、群落结构及其功能显得尤为重要。已有的研究主要集中在自然海 域微生物的群落特征，对海水养殖区尤其是大型海藻栽培区微生物群落特征所知 甚少。为揭示大型海藻栽培区微生物群落结构及功能，本研究以广东省汕头市南 澳岛龙须菜栽培区和相邻自然海区（对照区）为调查海域，通过采集不同季节、 不同水深的样品，提取DNA 并进行16S rRNA MiSeq 高通量测序及功能基因芯 片(GeoChip)杂交，比较了大型海藻龙须菜栽培区和对照区微生物群落差异，分 析了龙须菜体表附生微生物组成及功能，旨在探讨龙须菜规模栽培对微生物群落 的影响及其分子机理。所获结论对海洋环境保护和生物资源可持续利用具有重要 科学意义。 主要研究结果如下： 1. 于2014 年4 月，在南澳岛深澳湾龙须菜栽培区和对照区各设置3 个采样 点。每个采样点均采集表层水体、底层水体和沉积物，提取DNA 并纯化后，进 行 16S rRNA 基因MiSeq 测序。结果显示，18 个样品共产生超过530,000 条高 质量序列，生成3454 个OTU (Operational Taxonomic Units) ，分别属于28 个门, 74 个纲, 134 个目, 275 个科，618 个属。群落差异性检验(adonis)结果表明，龙须菜 栽培区和对照区表层水体微生物群落结构差异不明显，但底层水体和沉积物中微 生物群落结构差异显著(p 0.05) 。在表层和底层水体中，拟杆菌、α-变形菌和γ- 变形菌均为优势菌，其相对丰度在栽培区和对照区中有差异。沉积物中优势菌为 拟杆菌、γ-变形菌和ε-变形菌。在属水平上，栽培区表层水体中Aestuariibacter , Crocinitomix, Leucothrix (亮发菌属)及Tenacibaculum (黄杆菌属) 的相对丰度高于 对照区(p 0.05) 。底层水体中，栽培区Aestuariibacter , Bacillariophyta (硅藻门) 和 Croceitalea 的相对丰度高于对照区 (p 0.05) 。沉积物中，Arenibacter , Glaciecola, Halomonas ( 盐单胞菌属), Leisingera ( 亮发菌属), Maribacter , Peredibacter 和Sulfitobacter (亚硫酸杆菌)在龙须菜栽培区的相对丰度高于对照区 III (p 0.05) 。大型海藻栽培区相对丰度高的微生物种属与利用海藻多糖的微生物密 切相关，例如Arenibacter , Croceitalea, Glaciecola, Leucothrix 和Maribacter 。响应 比分析表明，栽培区表层和底层水体中显著变化的OTU 分别有89.9%和72%增 加了相对丰度；栽培区沉积物中显著变化的OTU 有84.5%降低了相对丰度。CCA 结果显示，栽培区水体微生物群落结构变化与温度、DO 、pH 和Chl-a