日程安排-中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中心试验室.pdf

附件 2 ： 中国农业科学院 北京畜牧兽医研究所中心实验室 蛋白质组学技术培训班 日程安排 2018 年3 月25 —3 月30 日 北 京 注册报到 （3 月25 日） 12:00 - 21:00 注册和培训资料领取 第一天 （3 月26 日） 8:30 - 8:45 开班仪式 8:50 - 9:00 培训内容及日程介绍 9:05 - 10:00 实验1:大肠杆菌总蛋白变性、还原及烷基化 10:10 - 11:00 第一讲: 基于质谱的蛋白质组分析实验设计和样品准备 11:15 - 12:00 第二讲:质谱原理及基本知识、术语 12:00 - 12:10 实验2: 蛋白质的液体酶切 12:15 - 13:30 午 餐 13:30 - 14:30 第三讲: 基于液质联用分析的蛋白质组分析流程 14:50 - 15:50 实验3: 实验室参观和仪器操作演示 16:00 - 17:00 第四讲: 基于质谱的蛋白质组学应用案例分析 17:00 - 17:40 实验4: 终止酶切和上机采集（90 分钟梯度） 18:00 晚餐 第二天 （3 月27 日） 8:30 -9:10 软件安装和数据传输 9:10 - 9:40 第五讲: Mascot 数据库检索和参数设置 9:40 – 11:20 实验5: 大肠杆菌质谱数据的数据库检索（Mascot 2.5） 11:20 – 12:00 第六讲: MaxQuant 数据库检索软件介绍 12:00 – 13:30 午 餐 13:30 - 15:00 实验6: 使用MaxQuant 定性和定量分析大肠杆菌蛋白 15:10 - 15:50 实验7: 使用MaxQuant 分析SILAC 和iTRAQ/TMT 数据 16:00 - 16:30 实验8: 使用MaxQuant 分析IP-MS 和PTMs 非标定量数据 16:40 - 17:10 第七讲: Mascot 和Maxquant 检索结果解释及理解 17:10 - 17:40 实验9 ：学员实验结果概述和问题分析 18:00 晚餐 第三天（3 月28 日） 8:30 – 9:00 第八讲 差异蛋白的统计分析（如何定义差异蛋白的阈值） 9:00 - 9:50 实验10 ：使用Perseus 统计分析MQ-TMT 成对样品的差异蛋白 10:00 - 10:50 实验11：使用Perseus 统计分析MQ-SILAC 多组间（ANOVA ） 的 差异蛋白 11:00 - 11:50 实验12 ：使用Perseus 统计分析非标记（LFQ ）成对样品的差异蛋白 12:00 - 13:30 午 餐 13:30 - 14:10 实验13 ：使用Perseus 统计分析TMT-6plex 数据的差异蛋白 14:20 - 15:20 第九讲：使用DAVID 6.8 和R 语言方法包Clusterprofiler 注释和富 集差异蛋白生物功能 (GO) 和生物通路（KEGG）、使用String10.0 分析蛋白质相互作用 15:30 - 16:20 实验14: DAVID 、Clusterprofiler 和String10.0 上机实践 16:30- 17:10 第十讲 使用在线工具可视化展示生物信息学分析结果 17:10 - 17