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分子生物学
结构分子生物学部分
绪论
①总述:进化论、细胞学说、生化遗传学、DNA的发现
②分子生物学:定义、研究内容(四方面)
③发展史:里程碑
④三个相关学科:生物化学、细胞生物学、遗传学
⑤中心法则:经典、现代
Ⅰ DNA
①结构:碱基比率、配对规则、种数(4n)、0.34nm的应用(碱基对M/2x,长度0.34×M/2x)
⑴三类DNA(ABZ):结构、形成、特点及Z-DNA的作用
⑵质粒超螺旋:正负超螺旋定义、转化、意义、计算、主要以负超螺旋存在
⑶其它:0.34nm的计算、※DNA稳定因素(PO43-)与Tm、Z-DNA不稳
②性质
⑴复性:五条件、机制(Cot曲线)、三个吸光度
⑵修饰:甲基化(ACG)
⑶变性:DNA碱性全变性、90OC以上全变性增色37%、增色效应(Tm)
⑷水解:酸(PH1,=4,甲基化DNA酸水解用处);碱(RNA PH:13,11,DNA去碱基易)
酶(内切、外切)
⑸DNA稳定因素:对应核苷酸的P同电相斥、Na+、Tm
⑹分子伴侣:作用、分类(热休克蛋白、伴侣素)、作用机理(四条)
Ⅱ tRNA
①形成:转录成三类,3‘去尾,5’斩头,化学修饰成稀有碱基(I、ψ)
②二级结构:四个臂(受体臂、反密码子臂、D臂、TψC臂),多余臂(2类),
tRNA长度决定因素(D臂、多余臂)
③三级结构:特点、二三级氢键、两个双螺旋、转折处()、两端点()
受体臂与反密码子臂距离远及原因
④功能:转运氨基酸(受体臂3‘-CCA)、解读密码子(反密码子臂)
⑤种类:tRNAi/tRNAe(起始/延伸),同工tRNA(定义)tRNA性质由反密码子决定
Ⅲ 核糖体
①核糖体的细胞学知识:见细胞生物学
②三个位点:A、P、E作用
③原核30S小亚基上16SrRNA反SD序列:结构(3ˊ富含嘧啶区GAUCACCUCCUUA)、作用
Ⅳ mRNA
①真原核比较:帽、尾、单多顺反子、起始密码子个数原核有三个起始密码子
(AUGGUGUUG)、T1/2、原核特有SD序列
②真核mRNA三类帽:0、1、2类定义
③原核mRNA的SD序列:5‘,作用,结构
Ⅴ蛋白质与核酶
①结构域:
②分子伴侣:分类、作用机制
③核酶:定义、分类(剪接、剪切)剪切分三类:锤头、发夹、丁肝病毒核酶
基因组学部分
Ⅰ 染色体
观察:有丝分裂中期光学显微镜可见
功能:遗传载体
作为遗传物质所需四要素:稳定、半保留复制、产生蛋白质、可变异
Ⅱ 真核基因组
①组成:DNA(或RNA)+Protain(组、非组)
②DNA:C值与C值反常现象、三序列(不重复、中度重复、高度重复)占序列比例,单/多拷贝
③组蛋白:六种、特征(保守、特例、氨基酸不对称、修饰、H5-赖氨酸)
④非组蛋白:三种常见,DNA结合蛋白的定义
⑤真核基因组结构基础--核小体
⑴组成:200bpDNA+八聚体
⑵八聚体:2×(H2A+H2B+H3+H4)
⑶结构:
颗粒(八聚体+120bpDNA链,直径10nm,DNA链绕1.65圈)
连接DNA(80bpDNA链+H1,H1作用)
是负超螺旋
⑥染色单体:螺线管、螺旋n倍
⑦端粒与端粒酶
⑴端粒:真核基因组末端,功能(防真核基因组末端结合)
⑵端粒酶:反转录酶、功能(反转录成端粒、连接后随链所得的冈崎片段)、
反转录机理(
Ⅲ 原核基因组
①真原核基因组比较:
大小(真核大,原核小)
复杂度(断裂/连续、大多为调控/表达区、重复序列/重叠基因)
复制(真核多向,原核单向)
转录(单顺反子/多顺反子)
真核特殊(DNA多态性、端粒)
②真原核基因表达的比较:复制、表达连续性及机理
Ⅳ 真核基因组结构
①hnRNA内含子:GU-AG法则,3‘嘧啶区,5‘保守区、3’上游18-50处的保守区
②启动子:核心(TATA,决定转录起始位点)、识别RNA聚合酶(CG、CAAT,决定转录起始频率)
③增强子:定义、结构、作用机制、特点、代表(β-珠蛋白基因)
④终止子:两类(依赖/不依赖ρ因子)、结构特点、作用机理、穷追模型
Ⅴ 原核基因组结构
①启动子:-35区(识别RNA聚合酶),-10区(结合RNA聚合酶)
Ⅵ 基因组学
①几个定义:重叠基因、断裂基因、基因家族、基因簇、超基因家族、假基因、管家基因、奢侈基因、组织特异性基因
②顺式与反式作用因子:
⑴顺式作用元件:定义,启动子、增强子、沉默子
⑵反式作用元件:定义,转录复合物
③人类基因组计划:
④比较基因组学:
基因表达部分
ⅠDNA复制
①半保留复制:定义、意义、发现(N14N15)
②半不连续复制:前导链、后随链、冈崎片段、过程、实验证明(电泳、30s)
③复制起点:复制叉、复制子、复制起点特征
④复制方式:线性-眼形,环状-3种(θ型、滚环型、D环型;各对应
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