蛋白质组学研究中的生物信息学.pptVIP

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2019-08-30 发布于湖北
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蛋白质组学研究中的生物信息学.ppt

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第4讲：基于生物质谱数据的互联网数据库搜索;本讲所要介绍的内容提要;Ⅰ、生物信息学的一般情况;生物信息学在蛋白质组学中的应用概况 ;Ⅱ、有关数据库的基础知识 ;Nucleic Acids Research》杂志在其每年的第一期中详细介绍最新版本的各种数据库。在2000年1月1日出版的28卷第一期115种通用和专用数据库，包括其详尽描述和访问网址。至2006年，生物信息学数据库总数已达858个。至2009年，生物信息学数据库总数已达1170个。《Nucleic Acids Research》杂志/;所介绍的相关数据库及其主要分类;生物信息学的基本构架;生物信息数据库的类别;基于肽质量指纹谱（PMF）信息的数据库搜索;蛋白质;肽质量指纹图数据的检索;现行的PMF软件工具;重点介绍MS Fit;以相关的质谱实验数据从序列数据库中进行发掘的蛋白质组学工具。;MS Fit;可选的数据库;可选的物种;;;可选的质谱仪;可选的酶;翻译后修饰种类的选择;质谱数据输入框;;MOWSE score: MOlecular Weight Search, Scoring based on peptide frequency distribution from the OWL non redundant Database %cov: total aa coverage %tic: fragments coverage;复习题