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基于Gateway 体系一步PCR 法构建CRISPR 终载体
准备:
Template 3 ng/uL (U3:PJF998 EcoRV 酶切回收;U6:PJF999 EcoRV 酶切回收)
OJP001/OJP002 混合工作液 10uM
Spacer-F/R 混合工作液 1uM
1. PCR 扩增
将OJP001/002 和靶点正反向引物同时加入反应体系中
植
Template Mix OJP001/002 Spacer-F/R KOD-FX ddH2O
物
0.2 uL 7 uL 0.6 uL 0.4 uL 0.2 uL 1.6 uL
仅
PCR 反应程序:
限 科
94℃ 2’ →( 98℃ 10’’ → 55℃ 20’’ → 68℃ 1’) X 45 cycles → 68℃ 5’ →25 ℃
自 学
2. LR 反应 最
PCR 产物 (0.4uL )与PJE045 做LR 反应 (可以做1uL 体系)3h 以上,电转(热
激转化)。用 前
3. 菌落PCR ,不 沿
U3-temp: OJP008 OJP026 做菌落PCR (411 bp ),提质粒、OJP026 测序。
微
U6a-temp: OJF320 OJP026 做菌落PCR (800 bp ),提质粒、OJP026 测序。
准 信
4.引物信息 商 公
OJP001 tcgcgttaacgctagcatggatctc
用
OJP002 gtaacatcagagattttgagacac 众
OJP026 TGCACATACAAATGGACGAA 号
OJP008 ACCACCTCGGCTATCCACA 粉
OJF320 catccactccaagctcttg
U3-Spacer-F-3’adapter ANNNNNNNNNNNgttttagagctatgctgaaa 丝
U3-Spacer-R-3’adapter NNNNNNNNNNNTtgccacggatcatctgcac 提
U6-Spacer-F-3’adapter GNNNNNNNNNNNgttttagagctagaaatag 供
U6-Spacer-R-3’adapter NNNNNNNNNNNCggcagccaagccagcaccc
5.质粒图谱
ojd405 F
OsU3J
OJF320
OJP008 U3 F
sgRNA OJP002
Eco RV (3508) OJP002
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