新颖的黏细菌模块化天然产物装配线-生物化学与生物物理进展.pdf

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2012, 39(6): 525~539 颖的黏细菌模块化天然产物装配线* ** 丽萍 黎志凤 韩 魁 李曙光 李越中 ( 东大学微生物技术国家重点实验室，济南250 100) 摘要 黏细菌的显著特征之一是能够合成结构多样、功能丰富的天然产物 模块化聚酮合酶(PKS)和非核糖体肽合成酶 (NRPS)途径是黏细菌合成天然产物的主要方式 与经典模块PKS/NRPS 相比，黏细菌来源的模块化PKS/NRPS 常表现出新 颖的装配特征，显示出多样化的遗传加工潜能和装配产物结构多样性 本文综合归类分析了黏细菌来源的模块化PKS/NRPS 遗传装配线类型及其对应化合物的生化结构特征，图文并茂地呈现了黏细菌在遗传、生化、组合生物合成、进化和药物开发 领域的生机和潜能，并展望了基因组学时代带来的契机 关键词 黏细菌，天然产物，聚酮合酶(PKS)，非核糖体肽合成酶(NRPS)，模块化 学科分类号 Q936，Q933 DOI: 10.3724/SP.J.1206.2011.00325 具有复杂多细胞形态发生特征的黏细菌在系统 核糖体肽合成酶(nonribosomal peptide synthetase， 分类上属于变形细菌门 分支，包括3 个亚目 17 NRPS)催化氨基酸单体连续缩合而成，装配过程与 个属[1-2] 黏细菌能够产生丰富多样的次级代谢产 脂肪酸合成类似，底物和中间产物在各功能域中传 物，是重要药源微生物类群[2-4] ，如，由纤维堆囊 递与加工，直至终产物的合成与释放[6-11] 微生物 菌(Sorangium cellulosum)产生的埃博霉素(epothilone) 来源的PKS/NRPS 至少存在3 种类型， 中模块化 氮杂修饰物Ixabepilone/Ixempra 已被美国食品药品 PKS/NRPS 构成一类独特装配线模式 近 10 年来， 监督管理 (food and drug administration ，FDA) 批 黏细菌模块PKS/NRPS 在遗传和生化领域取得了重 准作为一线抗癌药物[5] 近20 年来，已从黏细菌 要研究进展，相关化合物及 生物合成基因簇被陆 次级代谢产物中鉴定出100 种以上基本化学结构和 续鉴定，迄今已达 20 例[12-31] ，与经典模块化 近600 种结构衍生物[2, 6] ，包括芳香族、杂环、多 PKS/NRPS 不同，它们表现出独特的组织结构、特 烯、生物碱、大环、聚醚和肽类等， 中绝大部分 殊的遗传和生化特征 [6] 2007 年，Wenzel 等 对黏 化合物结构新颖 黏细菌的次级代谢产物合成具有 细菌模块化PKS/NRPS 天然产物装配线中6 个实例 菌株特异性，如epothilone 产生菌菌株阳性率仅为 进行了详尽综述 本文在Wenzel 等的报道基础上， 2%[3] 此外，黏细菌单一菌株可以产生多种不同结 就黏细菌来源的20 例模块PKS/NRPS 新颖装配线 [2, 4] 构的次级代谢产物 和同一基本结构的大量衍生 特征进行进一步阐述和归类分析 物 这些重要特征使黏细菌成为生物学活性次级代 1 经典模块化PKS/NRPS 装配线特征 谢产物研发的重要资源 据不完全统计，已知黏细菌次级代谢产物 经典模块化PKS(modular PKS) 由基因簇编码， 中约 1/3 为聚酮(polyketide ，PK) 或非核糖体肽 (non-ribosomal peptide ，