qPCR实验作业流程.docVIP

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qPCR实验作业流程 PAGE PAGE 5 Q-PCR实验流程 ①实验前准备,每天早上到实验室后,先把超净工作台的紫外灯打开15-20分钟。②超净台前做实验,需佩戴干净的橡胶手套/一次性薄膜手套,RNA抽提需带口罩。③取EP管/枪头时需用镊子,不可以用使用过的手套直接取用。取完EP管/枪头后,袋子及时封好。④橡胶手套须放入超净台照射紫外,实验操作过程中不得带出超净台,移液器在一天工作结束后调至最大量程,并用75%乙醇清洁移液器,枪头盒及超净台面。⑤实验进行的过程中或观看实验时,没有带口罩不要在超净台前讲话。 总RNA抽提 1)细胞培养皿中细胞样品用1*PBS洗两次后,用1ml枪将PBS吸干净,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至1.5ml RNase free EP管中使细胞充分裂解,室温静置5min; 组织样品用液氮充分研磨,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,混匀,室温放置5min使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称) 加入200μl氯仿,剧烈振荡混匀30s,使水相和有机相充分接触,室温静置3-5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序排好,与第一步的顺序一致) 3) 4℃下,14,000g离心15min,可见分为三层,RNA在上层水相,移至另一个新的RNase 沉淀RNA:加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次)(不应用振荡器混匀),室温静置10min; 4℃下,14,000g离心10min,收集RNA沉淀(如离心后仍不见EP管底部有沉淀,应将EP管放置在-80度冰箱过夜,继续在4℃下, 用75%乙醇洗涤两次(12,000g离心5min)(加入乙醇后只需轻轻颠倒EP管即可,不用振荡器震荡或枪头吸打沉淀),超净台风干;沉淀不能过干或过湿,过干则不易溶解,过湿则乙醇残留。 视沉淀量加入适量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。 三、去基因组 使用RNase-free的DNase ?(Promega),按以下体系配置反应液,37℃消化30min,65℃ RNA DNase ? 10 x buffer H2O(RNase free) RNasin 30 20 10 39.5 0.5 μl μl μl μl μl 总体积 100 μl 然后按以下步骤操作: 1) 加入等体积的苯酚/氯仿,上下颠倒混匀,室温放置5min,后14,000rpm,离心15min,取上清。 2) 加入等体积的氯仿,上下颠倒混匀,静置分层后14,000rpm,离心15min,取上清。 加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次),-20℃静置15 4℃下,14,000g 用75%乙醇洗涤两次(12,000g离心5min),超净台风干; 加入适量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。 四、总RNA纯度和完整性检测 纯度检测:取1μl RNA样品50倍稀释,在核酸蛋白检测仪上测定OD值,OD260/OD280的比值大于1.8,说明制备的RNA较纯,无蛋白质污染。 总RNA完整性检测:取RNA样品1μl,1%琼脂糖凝胶电泳80V×20min,EB染色10min,用凝胶成像系统观察并拍照,总RNA的5s rRNA, 18s rRNA和28s rRNA条带,三条条带完整的话即可证明总RNA抽提比较完整。 五、逆转录 1. mRNA: 在RNase free的PCR管中配置下列溶液. Total RNA H2O 1.0 μg μl 总体积 12 μl 将上述溶液吹打均匀,置85℃保温5min,使RNA变性。随后立即冰上致冷, 以防止RNA复性; 在该PCR管中加入下列试剂(Promega) oligo(dT) Random primer 10mM dNTP RNase inhibitor 5 x buffer M-MLV 0.5 0.5 2.0 0.5 4.0 0.5 μl μl μl μl μl μl 总体积 8.0 μl 将上述20μl反应溶液30℃ 42℃保温5 85℃保温10min -20℃ 2. microRNA: 使用茎环逆转录法,原理如下图: 在去RNase的PCR管中配置以下溶液. total RNA X个miR逆转录引物 H2O 1.0 0.5*X μg μl 总体积 12.5 μl 2)将上述溶液混匀,85℃孵育5min,以打开

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