静息态处理全过程PPT.ppt

Resting-state fMRI:Data Processing Outline 预处理 数据整理 数据整理 数据整理 数据整理 预处理 DICOM-NIFTI 预处理 预处理 Slice Timing Slice Timing Slice Timing Slice Timing 预处理 Realign Realign Realign 预处理 Normalize Normalize 预处理 Smooth Smooth 预处理 去线性漂移 预处理 滤波 滤波 Outline ALFF ALFF ReHo ReHo 功能连接 功能连接 功能连接 Outline 统计 单样本T检验 单样本T检验 单样本T检验 单样本T检验 单样本T检验 单样本T检验 双样本T检验 双样本T检验 双样本T检验 双样本T检验 双样本T检验 双样本T检验 Outline 结果呈现 结果呈现—SPM5 结果呈现—SPM5 结果呈现—xjview 结果呈现—xjview 结果呈现—rest_sliceviewer 结果呈现—MRIcroN 结果呈现—MRIcroN Outline 文献管理 文献管理 文献管理 文献管理 Thanks to 拼音顺序: 郭小娟 贺永 龙翔宇 宋晓伟 姚力 臧玉峰 张寒 朱朝喆 邹启红 左西年 …… Thanks for your attention! 上一步生成的 spm.mat 1 HeightthresholdT = 2.687659 {p0.05(FDR)} Extentthresholdk = 10 voxels spmT_0001.img PD_1T.img 准备制作双样本T检验的MASK 统计准备 ALFF：mALFF ReHo: smReHo FC: zFC Mask Mask Mask=PD_1T.img + CON_1T.img0 PD_1T.img CON_1T.img Mask_2T.img i1+i20 两组的m*图像; zFC图像 存放SPM.mat的目录 Mask_2T.img 上一步生成的 spm.mat 上一步生成的 spm.mat 1 -1 HeightthresholdT = Inf {p0.05(FDR)} Extentthresholdk = 0 voxels spmT_0001.img 预处理 ALFF, ReHo, FC 计算 统计 结果呈现 文献管理 SPM5 xjview rest_sliceviewer MRIcroN 预处理 ALFF, ReHo, FC 计算 统计 结果呈现 文献管理 将下载的ens格式文件复制到 D:\Program Files\EndNote X\Styles All the group members! 预处理 ALFF, ReHo, FC 计算 统计 结果呈现 文献管理 Zang et al., 2007 注意：预处理时不做平滑，计算完ReHo后再进行平滑。 Zang et al., 2004 提取协变量 头动参数: rp_name.txt 全脑信号、脑脊液、白质信号 提取协变量 提取协变量 提取协变量 提取协变量 提取协变量 提取协变量 提取协变量 提取协变量 头动参数: rp_name.txt 全脑信号、脑脊液、白质信号 协变量组合： RPCov=load(rp_name.txt); BCWCov=load(ROI_FCMap_name.txt); Cov=[RPCov,BCWCov]; save(Cov.txt, Cov, -ASCII, -DOUBLE,-TABS); Voxel-wise ROI-wise r=0.36 Voxel-wise Voxel-wise Voxel-wise Voxel-wise Voxel-wise Voxel-wise Voxel-wise 1 by 1 Cov.txt ROI-wise ROI-wise ROI-wise 1 by 1 Cov.txt 预处理 ALFF, ReHo, FC 计算 统计 结果呈现 文献管理 单样本T检验 双样本T检验 统计准备 ALFF: mALFF ReHo: smReHo FC: zFC mALFF-1, smReHo-1 m图像 1by 1 i1-1 m*-1图像; zFC图像 存放SPM.mat的目录 上一步生成的 spm.mat ** LOGO 严超赣 Ph. D. Candidate ycg.yan@ 北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室 ?2008 SKL